Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1BQ00975 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms