Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ERVK-21P61565 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ERVK-21P61565 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ERVK-21P61565 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ERVK-21P61565 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ERVK-21P61565 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ERVK-21P61565 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ERVK-21P61565 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ERVK-21P61565 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ERVK-21P61565 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ERVK-21P61565 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
ERVK-21P61565 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ERVK-21P61565 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ERVK-21P61565 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
ERVK-21P61565 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ERVK-21P61565 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ERVK-21P61565 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ERVK-21P61565 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ERVK-21P61565 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVK-21P61565 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVK-21P61565 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVK-21P61565 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVK-21P61565 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVK-21P61565 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVK-21P61565 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVK-21P61565 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVK-21P61565 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVK-21P61565 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVK-21P61565 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVK-21P61565 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVK-21P61565 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVK-21P61565 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVK-21P61565 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ERVK-21P61565 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVK-21P61565 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVK-21P61565 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVK-21P61565 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVK-21P61565 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVK-21P61565 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVK-21P61565 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVK-21P61565 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVK-21P61565 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVK-21P61565 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVK-21P61565 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVK-21P61565 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ERVK-21P61565 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms