Protein–RNA interactions for Protein: P57055

RIPPLY3, Protein ripply3, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY3P57055 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms