Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TAF6P49848 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TAF6P49848 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TAF6P49848 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TAF6P49848 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TAF6P49848 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TAF6P49848 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TAF6P49848 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TAF6P49848 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TAF6P49848 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TAF6P49848 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TAF6P49848 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TAF6P49848 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TAF6P49848 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TAF6P49848 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TAF6P49848 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TAF6P49848 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TAF6P49848 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TAF6P49848 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TAF6P49848 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TAF6P49848 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TAF6P49848 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TAF6P49848 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TAF6P49848 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TAF6P49848 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TAF6P49848 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TAF6P49848 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TAF6P49848 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TAF6P49848 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TAF6P49848 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TAF6P49848 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TAF6P49848 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TAF6P49848 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TAF6P49848 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TAF6P49848 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TAF6P49848 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TAF6P49848 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TAF6P49848 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TAF6P49848 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TAF6P49848 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TAF6P49848 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TAF6P49848 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TAF6P49848 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TAF6P49848 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TAF6P49848 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TAF6P49848 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TAF6P49848 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TAF6P49848 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TAF6P49848 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TAF6P49848 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TAF6P49848 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TAF6P49848 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TAF6P49848 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TAF6P49848 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TAF6P49848 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TAF6P49848 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TAF6P49848 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TAF6P49848 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TAF6P49848 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TAF6P49848 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TAF6P49848 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TAF6P49848 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TAF6P49848 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TAF6P49848 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TAF6P49848 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TAF6P49848 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TAF6P49848 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TAF6P49848 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TAF6P49848 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TAF6P49848 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TAF6P49848 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TAF6P49848 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TAF6P49848 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TAF6P49848 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TAF6P49848 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TAF6P49848 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TAF6P49848 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TAF6P49848 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TAF6P49848 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TAF6P49848 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TAF6P49848 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TAF6P49848 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TAF6P49848 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TAF6P49848 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TAF6P49848 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TAF6P49848 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TAF6P49848 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TAF6P49848 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TAF6P49848 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TAF6P49848 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TAF6P49848 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TAF6P49848 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TAF6P49848 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TAF6P49848 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TAF6P49848 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TAF6P49848 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TAF6P49848 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TAF6P49848 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TAF6P49848 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TAF6P49848 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms