Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK8P49336 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK8P49336 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK8P49336 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK8P49336 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK8P49336 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK8P49336 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK8P49336 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK8P49336 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK8P49336 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK8P49336 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK8P49336 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK8P49336 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK8P49336 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK8P49336 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK8P49336 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK8P49336 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK8P49336 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK8P49336 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK8P49336 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK8P49336 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK8P49336 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK8P49336 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK8P49336 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK8P49336 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK8P49336 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK8P49336 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK8P49336 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK8P49336 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK8P49336 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK8P49336 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK8P49336 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK8P49336 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK8P49336 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK8P49336 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK8P49336 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK8P49336 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK8P49336 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK8P49336 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK8P49336 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK8P49336 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK8P49336 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK8P49336 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK8P49336 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK8P49336 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK8P49336 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK8P49336 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK8P49336 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK8P49336 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK8P49336 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK8P49336 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK8P49336 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK8P49336 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK8P49336 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK8P49336 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK8P49336 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK8P49336 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK8P49336 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK8P49336 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK8P49336 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK8P49336 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK8P49336 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK8P49336 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK8P49336 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK8P49336 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK8P49336 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK8P49336 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK8P49336 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK8P49336 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK8P49336 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK8P49336 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CDK8P49336 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDK8P49336 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDK8P49336 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDK8P49336 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK8P49336 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK8P49336 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK8P49336 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK8P49336 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK8P49336 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK8P49336 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK8P49336 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK8P49336 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK8P49336 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK8P49336 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK8P49336 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK8P49336 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK8P49336 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK8P49336 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK8P49336 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK8P49336 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK8P49336 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK8P49336 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK8P49336 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK8P49336 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK8P49336 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK8P49336 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK8P49336 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK8P49336 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK8P49336 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms