Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LTBRP36941 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LTBRP36941 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LTBRP36941 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LTBRP36941 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LTBRP36941 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LTBRP36941 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LTBRP36941 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LTBRP36941 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LTBRP36941 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LTBRP36941 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LTBRP36941 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LTBRP36941 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LTBRP36941 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LTBRP36941 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LTBRP36941 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
LTBRP36941 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LTBRP36941 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LTBRP36941 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LTBRP36941 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LTBRP36941 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LTBRP36941 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LTBRP36941 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LTBRP36941 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LTBRP36941 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LTBRP36941 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LTBRP36941 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LTBRP36941 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LTBRP36941 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LTBRP36941 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LTBRP36941 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LTBRP36941 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LTBRP36941 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LTBRP36941 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LTBRP36941 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LTBRP36941 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LTBRP36941 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LTBRP36941 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LTBRP36941 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LTBRP36941 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LTBRP36941 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LTBRP36941 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
LTBRP36941 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
LTBRP36941 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LTBRP36941 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LTBRP36941 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LTBRP36941 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LTBRP36941 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LTBRP36941 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LTBRP36941 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LTBRP36941 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LTBRP36941 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LTBRP36941 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LTBRP36941 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LTBRP36941 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LTBRP36941 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LTBRP36941 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LTBRP36941 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LTBRP36941 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LTBRP36941 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LTBRP36941 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LTBRP36941 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LTBRP36941 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LTBRP36941 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
LTBRP36941 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LTBRP36941 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LTBRP36941 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LTBRP36941 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LTBRP36941 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LTBRP36941 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LTBRP36941 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LTBRP36941 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LTBRP36941 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LTBRP36941 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LTBRP36941 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LTBRP36941 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LTBRP36941 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LTBRP36941 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LTBRP36941 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LTBRP36941 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LTBRP36941 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LTBRP36941 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LTBRP36941 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LTBRP36941 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LTBRP36941 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LTBRP36941 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LTBRP36941 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LTBRP36941 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LTBRP36941 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LTBRP36941 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LTBRP36941 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LTBRP36941 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LTBRP36941 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LTBRP36941 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LTBRP36941 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LTBRP36941 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LTBRP36941 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
LTBRP36941 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LTBRP36941 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LTBRP36941 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms