Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRAP18433 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRAP18433 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
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