Protein–RNA interactions for Protein: P16070

CD44, CD44 antigen, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD44P16070 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CD44P16070 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CD44P16070 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CD44P16070 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CD44P16070 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CD44P16070 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CD44P16070 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CD44P16070 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CD44P16070 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CD44P16070 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CD44P16070 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CD44P16070 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CD44P16070 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CD44P16070 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CD44P16070 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CD44P16070 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CD44P16070 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CD44P16070 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD44P16070 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD44P16070 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD44P16070 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD44P16070 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD44P16070 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD44P16070 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD44P16070 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD44P16070 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD44P16070 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD44P16070 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD44P16070 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD44P16070 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD44P16070 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CD44P16070 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD44P16070 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD44P16070 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD44P16070 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD44P16070 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD44P16070 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD44P16070 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD44P16070 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD44P16070 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD44P16070 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD44P16070 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD44P16070 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD44P16070 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD44P16070 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD44P16070 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CD44P16070 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD44P16070 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD44P16070 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD44P16070 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD44P16070 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD44P16070 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD44P16070 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD44P16070 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD44P16070 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD44P16070 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD44P16070 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CD44P16070 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD44P16070 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CD44P16070 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD44P16070 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD44P16070 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD44P16070 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD44P16070 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD44P16070 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CD44P16070 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD44P16070 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD44P16070 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD44P16070 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD44P16070 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD44P16070 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD44P16070 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD44P16070 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD44P16070 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD44P16070 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CD44P16070 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD44P16070 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CD44P16070 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD44P16070 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD44P16070 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD44P16070 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD44P16070 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD44P16070 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD44P16070 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD44P16070 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD44P16070 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD44P16070 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD44P16070 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD44P16070 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD44P16070 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD44P16070 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD44P16070 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD44P16070 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD44P16070 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD44P16070 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CD44P16070 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD44P16070 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD44P16070 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD44P16070 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD44P16070 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms