Protein–RNA interactions for Protein: P14324

FDPS, Farnesyl pyrophosphate synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDPSP14324 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FDPSP14324 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FDPSP14324 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FDPSP14324 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FDPSP14324 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FDPSP14324 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FDPSP14324 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FDPSP14324 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FDPSP14324 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FDPSP14324 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FDPSP14324 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FDPSP14324 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FDPSP14324 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FDPSP14324 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FDPSP14324 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FDPSP14324 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FDPSP14324 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FDPSP14324 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FDPSP14324 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FDPSP14324 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FDPSP14324 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FDPSP14324 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FDPSP14324 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FDPSP14324 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FDPSP14324 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FDPSP14324 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FDPSP14324 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FDPSP14324 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FDPSP14324 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FDPSP14324 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FDPSP14324 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
FDPSP14324 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FDPSP14324 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
FDPSP14324 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FDPSP14324 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FDPSP14324 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FDPSP14324 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FDPSP14324 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FDPSP14324 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FDPSP14324 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FDPSP14324 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FDPSP14324 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FDPSP14324 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FDPSP14324 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FDPSP14324 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FDPSP14324 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FDPSP14324 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FDPSP14324 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FDPSP14324 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FDPSP14324 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FDPSP14324 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FDPSP14324 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FDPSP14324 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FDPSP14324 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FDPSP14324 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FDPSP14324 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FDPSP14324 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FDPSP14324 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FDPSP14324 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FDPSP14324 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FDPSP14324 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FDPSP14324 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FDPSP14324 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FDPSP14324 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FDPSP14324 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FDPSP14324 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FDPSP14324 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FDPSP14324 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FDPSP14324 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FDPSP14324 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FDPSP14324 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FDPSP14324 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FDPSP14324 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FDPSP14324 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FDPSP14324 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FDPSP14324 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FDPSP14324 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FDPSP14324 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FDPSP14324 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FDPSP14324 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
FDPSP14324 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
FDPSP14324 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FDPSP14324 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FDPSP14324 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FDPSP14324 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FDPSP14324 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FDPSP14324 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FDPSP14324 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FDPSP14324 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FDPSP14324 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FDPSP14324 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FDPSP14324 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FDPSP14324 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FDPSP14324 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FDPSP14324 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FDPSP14324 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FDPSP14324 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FDPSP14324 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FDPSP14324 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FDPSP14324 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms