Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BMP3P12645 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BMP3P12645 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BMP3P12645 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BMP3P12645 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BMP3P12645 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BMP3P12645 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BMP3P12645 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BMP3P12645 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
BMP3P12645 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BMP3P12645 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BMP3P12645 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BMP3P12645 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BMP3P12645 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
BMP3P12645 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BMP3P12645 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BMP3P12645 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
BMP3P12645 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
BMP3P12645 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BMP3P12645 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BMP3P12645 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BMP3P12645 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BMP3P12645 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BMP3P12645 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BMP3P12645 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BMP3P12645 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
BMP3P12645 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BMP3P12645 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BMP3P12645 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BMP3P12645 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BMP3P12645 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BMP3P12645 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
BMP3P12645 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BMP3P12645 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BMP3P12645 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BMP3P12645 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
BMP3P12645 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BMP3P12645 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BMP3P12645 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BMP3P12645 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BMP3P12645 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BMP3P12645 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BMP3P12645 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BMP3P12645 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BMP3P12645 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BMP3P12645 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BMP3P12645 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BMP3P12645 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BMP3P12645 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BMP3P12645 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BMP3P12645 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BMP3P12645 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BMP3P12645 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BMP3P12645 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BMP3P12645 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BMP3P12645 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BMP3P12645 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BMP3P12645 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BMP3P12645 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BMP3P12645 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BMP3P12645 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BMP3P12645 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BMP3P12645 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BMP3P12645 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BMP3P12645 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BMP3P12645 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BMP3P12645 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.19
BMP3P12645 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BMP3P12645 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BMP3P12645 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BMP3P12645 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BMP3P12645 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BMP3P12645 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BMP3P12645 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BMP3P12645 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BMP3P12645 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BMP3P12645 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BMP3P12645 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BMP3P12645 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BMP3P12645 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BMP3P12645 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BMP3P12645 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BMP3P12645 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BMP3P12645 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BMP3P12645 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BMP3P12645 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BMP3P12645 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BMP3P12645 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BMP3P12645 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BMP3P12645 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BMP3P12645 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
BMP3P12645 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BMP3P12645 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BMP3P12645 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BMP3P12645 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BMP3P12645 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BMP3P12645 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
BMP3P12645 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BMP3P12645 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BMP3P12645 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms