Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
TOP2AP11388 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
TOP2AP11388 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
TOP2AP11388 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
TOP2AP11388 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
TOP2AP11388 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
TOP2AP11388 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
TOP2AP11388 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
TOP2AP11388 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
TOP2AP11388 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
TOP2AP11388 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
TOP2AP11388 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC34.3■■■■□ 3.08
TOP2AP11388 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
TOP2AP11388 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
TOP2AP11388 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
TOP2AP11388 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
TOP2AP11388 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
TOP2AP11388 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
TOP2AP11388 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
TOP2AP11388 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
TOP2AP11388 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
TOP2AP11388 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
TOP2AP11388 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
TOP2AP11388 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
TOP2AP11388 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
TOP2AP11388 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
TOP2AP11388 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
TOP2AP11388 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
TOP2AP11388 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
TOP2AP11388 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
TOP2AP11388 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
TOP2AP11388 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
TOP2AP11388 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
TOP2AP11388 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
TOP2AP11388 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
TOP2AP11388 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
TOP2AP11388 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
TOP2AP11388 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
TOP2AP11388 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
TOP2AP11388 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
TOP2AP11388 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
TOP2AP11388 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC34.28■■■■□ 3.08
TOP2AP11388 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
TOP2AP11388 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
TOP2AP11388 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
TOP2AP11388 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
TOP2AP11388 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
TOP2AP11388 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
TOP2AP11388 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
TOP2AP11388 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
TOP2AP11388 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
TOP2AP11388 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
TOP2AP11388 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
TOP2AP11388 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
TOP2AP11388 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
TOP2AP11388 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
TOP2AP11388 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
TOP2AP11388 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
TOP2AP11388 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC34.27■■■■□ 3.08
TOP2AP11388 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
TOP2AP11388 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
TOP2AP11388 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
TOP2AP11388 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC34.27■■■■□ 3.08
TOP2AP11388 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC34.27■■■■□ 3.08
TOP2AP11388 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
TOP2AP11388 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
TOP2AP11388 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
TOP2AP11388 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
TOP2AP11388 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
TOP2AP11388 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
TOP2AP11388 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.08
TOP2AP11388 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
TOP2AP11388 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
TOP2AP11388 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
TOP2AP11388 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
TOP2AP11388 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.07
TOP2AP11388 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
TOP2AP11388 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
TOP2AP11388 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
TOP2AP11388 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
TOP2AP11388 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
TOP2AP11388 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
TOP2AP11388 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
TOP2AP11388 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
TOP2AP11388 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
TOP2AP11388 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
TOP2AP11388 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
TOP2AP11388 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
TOP2AP11388 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
TOP2AP11388 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
TOP2AP11388 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
TOP2AP11388 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
TOP2AP11388 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
TOP2AP11388 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
TOP2AP11388 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
TOP2AP11388 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
TOP2AP11388 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
TOP2AP11388 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
TOP2AP11388 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
TOP2AP11388 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms