Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHGAP10645 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHGAP10645 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHGAP10645 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHGAP10645 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHGAP10645 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHGAP10645 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHGAP10645 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHGAP10645 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHGAP10645 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHGAP10645 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHGAP10645 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHGAP10645 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHGAP10645 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHGAP10645 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHGAP10645 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CHGAP10645 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHGAP10645 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHGAP10645 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHGAP10645 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CHGAP10645 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHGAP10645 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CHGAP10645 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CHGAP10645 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHGAP10645 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHGAP10645 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHGAP10645 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHGAP10645 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHGAP10645 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHGAP10645 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHGAP10645 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHGAP10645 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHGAP10645 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHGAP10645 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHGAP10645 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHGAP10645 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHGAP10645 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHGAP10645 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHGAP10645 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHGAP10645 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHGAP10645 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHGAP10645 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHGAP10645 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CHGAP10645 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHGAP10645 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHGAP10645 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHGAP10645 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHGAP10645 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHGAP10645 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHGAP10645 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHGAP10645 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHGAP10645 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHGAP10645 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHGAP10645 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
CHGAP10645 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHGAP10645 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHGAP10645 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHGAP10645 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHGAP10645 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHGAP10645 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHGAP10645 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CHGAP10645 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHGAP10645 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHGAP10645 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHGAP10645 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CHGAP10645 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CHGAP10645 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHGAP10645 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHGAP10645 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHGAP10645 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHGAP10645 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHGAP10645 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHGAP10645 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHGAP10645 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHGAP10645 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHGAP10645 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHGAP10645 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHGAP10645 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHGAP10645 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHGAP10645 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CHGAP10645 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHGAP10645 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CHGAP10645 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHGAP10645 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHGAP10645 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHGAP10645 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHGAP10645 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHGAP10645 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHGAP10645 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHGAP10645 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHGAP10645 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHGAP10645 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHGAP10645 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHGAP10645 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHGAP10645 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHGAP10645 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHGAP10645 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CHGAP10645 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHGAP10645 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHGAP10645 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms