Protein–RNA interactions for Protein: O95613

PCNT, Pericentrin, humanhuman

Predictions only

Length 3,336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNTO95613 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCNTO95613 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCNTO95613 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCNTO95613 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCNTO95613 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCNTO95613 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCNTO95613 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCNTO95613 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCNTO95613 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCNTO95613 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCNTO95613 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCNTO95613 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCNTO95613 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCNTO95613 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCNTO95613 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCNTO95613 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PCNTO95613 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PCNTO95613 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PCNTO95613 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PCNTO95613 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PCNTO95613 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PCNTO95613 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PCNTO95613 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PCNTO95613 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PCNTO95613 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCNTO95613 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCNTO95613 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCNTO95613 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCNTO95613 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCNTO95613 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCNTO95613 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCNTO95613 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCNTO95613 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCNTO95613 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCNTO95613 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCNTO95613 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PCNTO95613 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PCNTO95613 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCNTO95613 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCNTO95613 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCNTO95613 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PCNTO95613 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCNTO95613 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCNTO95613 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCNTO95613 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCNTO95613 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PCNTO95613 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCNTO95613 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCNTO95613 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCNTO95613 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCNTO95613 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCNTO95613 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCNTO95613 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCNTO95613 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCNTO95613 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCNTO95613 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCNTO95613 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCNTO95613 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCNTO95613 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCNTO95613 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCNTO95613 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCNTO95613 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCNTO95613 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCNTO95613 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCNTO95613 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCNTO95613 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCNTO95613 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCNTO95613 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCNTO95613 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCNTO95613 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PCNTO95613 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PCNTO95613 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCNTO95613 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCNTO95613 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PCNTO95613 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCNTO95613 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCNTO95613 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCNTO95613 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCNTO95613 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCNTO95613 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCNTO95613 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCNTO95613 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCNTO95613 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCNTO95613 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCNTO95613 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCNTO95613 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PCNTO95613 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCNTO95613 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCNTO95613 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCNTO95613 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCNTO95613 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCNTO95613 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCNTO95613 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PCNTO95613 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCNTO95613 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCNTO95613 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PCNTO95613 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCNTO95613 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCNTO95613 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCNTO95613 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms