Protein–RNA interactions for Protein: O75143

ATG13, Autophagy-related protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13O75143 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG13O75143 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG13O75143 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG13O75143 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG13O75143 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG13O75143 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG13O75143 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG13O75143 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG13O75143 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG13O75143 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG13O75143 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG13O75143 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG13O75143 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG13O75143 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG13O75143 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG13O75143 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG13O75143 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG13O75143 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG13O75143 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG13O75143 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG13O75143 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG13O75143 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG13O75143 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG13O75143 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG13O75143 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG13O75143 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG13O75143 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG13O75143 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG13O75143 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG13O75143 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG13O75143 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG13O75143 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG13O75143 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATG13O75143 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG13O75143 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG13O75143 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG13O75143 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG13O75143 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG13O75143 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG13O75143 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG13O75143 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG13O75143 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG13O75143 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG13O75143 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG13O75143 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG13O75143 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG13O75143 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG13O75143 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG13O75143 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG13O75143 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG13O75143 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG13O75143 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG13O75143 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG13O75143 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG13O75143 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG13O75143 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG13O75143 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG13O75143 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG13O75143 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG13O75143 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG13O75143 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG13O75143 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG13O75143 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG13O75143 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG13O75143 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG13O75143 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG13O75143 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG13O75143 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG13O75143 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG13O75143 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG13O75143 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG13O75143 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG13O75143 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG13O75143 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG13O75143 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG13O75143 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG13O75143 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG13O75143 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG13O75143 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG13O75143 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG13O75143 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG13O75143 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
ATG13O75143 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATG13O75143 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATG13O75143 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATG13O75143 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATG13O75143 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATG13O75143 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATG13O75143 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATG13O75143 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATG13O75143 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATG13O75143 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATG13O75143 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATG13O75143 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATG13O75143 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ATG13O75143 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ATG13O75143 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ATG13O75143 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ATG13O75143 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ATG13O75143 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms