Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms