Protein–RNA interactions for Protein: O00411

POLRMT, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLRMTO00411 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLRMTO00411 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLRMTO00411 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
POLRMTO00411 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
POLRMTO00411 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
POLRMTO00411 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
POLRMTO00411 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLRMTO00411 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLRMTO00411 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLRMTO00411 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLRMTO00411 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLRMTO00411 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
POLRMTO00411 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLRMTO00411 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLRMTO00411 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLRMTO00411 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLRMTO00411 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
POLRMTO00411 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLRMTO00411 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLRMTO00411 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLRMTO00411 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLRMTO00411 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLRMTO00411 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLRMTO00411 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLRMTO00411 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLRMTO00411 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLRMTO00411 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
POLRMTO00411 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLRMTO00411 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLRMTO00411 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLRMTO00411 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLRMTO00411 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLRMTO00411 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLRMTO00411 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLRMTO00411 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLRMTO00411 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLRMTO00411 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
POLRMTO00411 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLRMTO00411 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLRMTO00411 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLRMTO00411 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLRMTO00411 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLRMTO00411 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
POLRMTO00411 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLRMTO00411 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLRMTO00411 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLRMTO00411 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLRMTO00411 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLRMTO00411 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
POLRMTO00411 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLRMTO00411 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLRMTO00411 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLRMTO00411 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLRMTO00411 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLRMTO00411 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
POLRMTO00411 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLRMTO00411 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
POLRMTO00411 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLRMTO00411 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLRMTO00411 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLRMTO00411 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLRMTO00411 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLRMTO00411 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLRMTO00411 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLRMTO00411 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLRMTO00411 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
POLRMTO00411 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLRMTO00411 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLRMTO00411 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLRMTO00411 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLRMTO00411 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLRMTO00411 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLRMTO00411 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
POLRMTO00411 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLRMTO00411 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLRMTO00411 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLRMTO00411 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLRMTO00411 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLRMTO00411 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLRMTO00411 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLRMTO00411 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLRMTO00411 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLRMTO00411 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLRMTO00411 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLRMTO00411 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLRMTO00411 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLRMTO00411 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLRMTO00411 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLRMTO00411 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLRMTO00411 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLRMTO00411 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLRMTO00411 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLRMTO00411 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLRMTO00411 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLRMTO00411 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLRMTO00411 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLRMTO00411 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLRMTO00411 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLRMTO00411 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLRMTO00411 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms