Protein–RNA interactions for Protein: F6WH68

RTEL1-TNFRSF6B, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC29■■■□□ 2.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC29■■■□□ 2.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC29■■■□□ 2.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC29■■■□□ 2.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms