Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
E2F8A0AVK6 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms