Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm3550W4VSN7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm3550W4VSN7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm3550W4VSN7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm3550W4VSN7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm3550W4VSN7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm3550W4VSN7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm3550W4VSN7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm3550W4VSN7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm3550W4VSN7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm3550W4VSN7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm3550W4VSN7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm3550W4VSN7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm3550W4VSN7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm3550W4VSN7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm3550W4VSN7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm3550W4VSN7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm3550W4VSN7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm3550W4VSN7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm3550W4VSN7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm3550W4VSN7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm3550W4VSN7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm3550W4VSN7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm3550W4VSN7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm3550W4VSN7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm3550W4VSN7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm3550W4VSN7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm3550W4VSN7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm3550W4VSN7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm3550W4VSN7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm3550W4VSN7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm3550W4VSN7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm3550W4VSN7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm3550W4VSN7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm3550W4VSN7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm3550W4VSN7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm3550W4VSN7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm3550W4VSN7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm3550W4VSN7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm3550W4VSN7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm3550W4VSN7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm3550W4VSN7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm3550W4VSN7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm3550W4VSN7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm3550W4VSN7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm3550W4VSN7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm3550W4VSN7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm3550W4VSN7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm3550W4VSN7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm3550W4VSN7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm3550W4VSN7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm3550W4VSN7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm3550W4VSN7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm3550W4VSN7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm3550W4VSN7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm3550W4VSN7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm3550W4VSN7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm3550W4VSN7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm3550W4VSN7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm3550W4VSN7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm3550W4VSN7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm3550W4VSN7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm3550W4VSN7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm3550W4VSN7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm3550W4VSN7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm3550W4VSN7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm3550W4VSN7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm3550W4VSN7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm3550W4VSN7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm3550W4VSN7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm3550W4VSN7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm3550W4VSN7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm3550W4VSN7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm3550W4VSN7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm3550W4VSN7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Gm3550W4VSN7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm3550W4VSN7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm3550W4VSN7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm3550W4VSN7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm3550W4VSN7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm3550W4VSN7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm3550W4VSN7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm3550W4VSN7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm3550W4VSN7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm3550W4VSN7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm3550W4VSN7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm3550W4VSN7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm3550W4VSN7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm3550W4VSN7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm3550W4VSN7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm3550W4VSN7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm3550W4VSN7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm3550W4VSN7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm3550W4VSN7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm3550W4VSN7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm3550W4VSN7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm3550W4VSN7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm3550W4VSN7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm3550W4VSN7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm3550W4VSN7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms