Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2H7

Gipc2, PDZ domain-containing protein GIPC2, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gipc2Q9Z2H7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23,26■■□□□ 1,31
Gipc2Q9Z2H7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23,26■■□□□ 1,31
Gipc2Q9Z2H7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,26■■□□□ 1,31
Gipc2Q9Z2H7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23,26■■□□□ 1,31
Gipc2Q9Z2H7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,26■■□□□ 1,31
Gipc2Q9Z2H7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,25■■□□□ 1,31
Gipc2Q9Z2H7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23,25■■□□□ 1,31
Gipc2Q9Z2H7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23,25■■□□□ 1,31
Gipc2Q9Z2H7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,25■■□□□ 1,31
Gipc2Q9Z2H7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,25■■□□□ 1,31
Gipc2Q9Z2H7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,24■■□□□ 1,31
Gipc2Q9Z2H7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23,24■■□□□ 1,31
Gipc2Q9Z2H7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,24■■□□□ 1,31
Gipc2Q9Z2H7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23,24■■□□□ 1,31
Gipc2Q9Z2H7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23,24■■□□□ 1,31
Gipc2Q9Z2H7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,24■■□□□ 1,31
Gipc2Q9Z2H7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,23■■□□□ 1,31
Gipc2Q9Z2H7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,23■■□□□ 1,31
Gipc2Q9Z2H7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23,23■■□□□ 1,31
Gipc2Q9Z2H7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23,23■■□□□ 1,31
Gipc2Q9Z2H7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23,23■■□□□ 1,31
Gipc2Q9Z2H7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,22■■□□□ 1,31
Gipc2Q9Z2H7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23,22■■□□□ 1,31
Gipc2Q9Z2H7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,22■■□□□ 1,31
Gipc2Q9Z2H7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23,21■■□□□ 1,31
Gipc2Q9Z2H7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,21■■□□□ 1,31
Gipc2Q9Z2H7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23,21■■□□□ 1,31
Gipc2Q9Z2H7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23,2■■□□□ 1,3
Gipc2Q9Z2H7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,2■■□□□ 1,3
Gipc2Q9Z2H7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,2■■□□□ 1,3
Gipc2Q9Z2H7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23,2■■□□□ 1,3
Gipc2Q9Z2H7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23,19■■□□□ 1,3
Gipc2Q9Z2H7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,19■■□□□ 1,3
Gipc2Q9Z2H7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,18■■□□□ 1,3
Gipc2Q9Z2H7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,18■■□□□ 1,3
Gipc2Q9Z2H7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,18■■□□□ 1,3
Gipc2Q9Z2H7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,17■■□□□ 1,3
Gipc2Q9Z2H7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23,17■■□□□ 1,3
Gipc2Q9Z2H7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,16■■□□□ 1,3
Gipc2Q9Z2H7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23,16■■□□□ 1,3
Gipc2Q9Z2H7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23,16■■□□□ 1,3
Gipc2Q9Z2H7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,16■■□□□ 1,3
Gipc2Q9Z2H7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23,16■■□□□ 1,3
Gipc2Q9Z2H7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,15■■□□□ 1,3
Gipc2Q9Z2H7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23,15■■□□□ 1,3
Gipc2Q9Z2H7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23,15■■□□□ 1,3
Gipc2Q9Z2H7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23,15■■□□□ 1,3
Gipc2Q9Z2H7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23,15■■□□□ 1,3
Gipc2Q9Z2H7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,15■■□□□ 1,3
Gipc2Q9Z2H7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,15■■□□□ 1,3
Gipc2Q9Z2H7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23,14■■□□□ 1,3
Gipc2Q9Z2H7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,13■■□□□ 1,29
Gipc2Q9Z2H7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,13■■□□□ 1,29
Gipc2Q9Z2H7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,12■■□□□ 1,29
Gipc2Q9Z2H7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,12■■□□□ 1,29
Gipc2Q9Z2H7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,11■■□□□ 1,29
Gipc2Q9Z2H7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23,11■■□□□ 1,29
Gipc2Q9Z2H7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23,11■■□□□ 1,29
Gipc2Q9Z2H7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,1■■□□□ 1,29
Gipc2Q9Z2H7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,1■■□□□ 1,29
Gipc2Q9Z2H7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,1■■□□□ 1,29
Gipc2Q9Z2H7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,08■■□□□ 1,29
Gipc2Q9Z2H7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,08■■□□□ 1,29
Gipc2Q9Z2H7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,08■■□□□ 1,29
Gipc2Q9Z2H7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,08■■□□□ 1,28
Gipc2Q9Z2H7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23,07■■□□□ 1,28
Gipc2Q9Z2H7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,06■■□□□ 1,28
Gipc2Q9Z2H7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,06■■□□□ 1,28
Gipc2Q9Z2H7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,06■■□□□ 1,28
Gipc2Q9Z2H7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,06■■□□□ 1,28
Gipc2Q9Z2H7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,05■■□□□ 1,28
Gipc2Q9Z2H7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23,05■■□□□ 1,28
Gipc2Q9Z2H7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,05■■□□□ 1,28
Gipc2Q9Z2H7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23,04■■□□□ 1,28
Gipc2Q9Z2H7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23,04■■□□□ 1,28
Gipc2Q9Z2H7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,03■■□□□ 1,28
Gipc2Q9Z2H7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,03■■□□□ 1,28
Gipc2Q9Z2H7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,02■■□□□ 1,28
Gipc2Q9Z2H7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23,02■■□□□ 1,28
Gipc2Q9Z2H7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23,01■■□□□ 1,27
Gipc2Q9Z2H7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23,01■■□□□ 1,27
Gipc2Q9Z2H7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23,01■■□□□ 1,27
Gipc2Q9Z2H7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,01■■□□□ 1,27
Gipc2Q9Z2H7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23,01■■□□□ 1,27
Gipc2Q9Z2H7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22,99■■□□□ 1,27
Gipc2Q9Z2H7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22,98■■□□□ 1,27
Gipc2Q9Z2H7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,98■■□□□ 1,27
Gipc2Q9Z2H7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22,98■■□□□ 1,27
Gipc2Q9Z2H7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,98■■□□□ 1,27
Gipc2Q9Z2H7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,98■■□□□ 1,27
Gipc2Q9Z2H7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22,98■■□□□ 1,27
Gipc2Q9Z2H7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22,97■■□□□ 1,27
Gipc2Q9Z2H7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22,97■■□□□ 1,27
Gipc2Q9Z2H7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22,96■■□□□ 1,27
Gipc2Q9Z2H7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22,96■■□□□ 1,27
Gipc2Q9Z2H7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,95■■□□□ 1,26
Gipc2Q9Z2H7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,95■■□□□ 1,26
Gipc2Q9Z2H7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22,95■■□□□ 1,26
Gipc2Q9Z2H7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22,95■■□□□ 1,26
Gipc2Q9Z2H7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22,94■■□□□ 1,26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17,3 ms