Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2H5

Epb41l1, Band 4.1-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 879 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41l1Q9Z2H5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Epb41l1Q9Z2H5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Epb41l1Q9Z2H5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Epb41l1Q9Z2H5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Epb41l1Q9Z2H5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Epb41l1Q9Z2H5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Epb41l1Q9Z2H5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Epb41l1Q9Z2H5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Epb41l1Q9Z2H5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Epb41l1Q9Z2H5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Epb41l1Q9Z2H5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Epb41l1Q9Z2H5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Epb41l1Q9Z2H5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Epb41l1Q9Z2H5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Epb41l1Q9Z2H5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Epb41l1Q9Z2H5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Epb41l1Q9Z2H5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Epb41l1Q9Z2H5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Epb41l1Q9Z2H5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Epb41l1Q9Z2H5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Epb41l1Q9Z2H5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Epb41l1Q9Z2H5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Epb41l1Q9Z2H5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Epb41l1Q9Z2H5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Epb41l1Q9Z2H5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Epb41l1Q9Z2H5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Epb41l1Q9Z2H5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Epb41l1Q9Z2H5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Epb41l1Q9Z2H5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Epb41l1Q9Z2H5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Epb41l1Q9Z2H5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Epb41l1Q9Z2H5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Epb41l1Q9Z2H5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Epb41l1Q9Z2H5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Epb41l1Q9Z2H5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Epb41l1Q9Z2H5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Epb41l1Q9Z2H5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Epb41l1Q9Z2H5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Epb41l1Q9Z2H5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Epb41l1Q9Z2H5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Epb41l1Q9Z2H5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Epb41l1Q9Z2H5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Epb41l1Q9Z2H5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Epb41l1Q9Z2H5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Epb41l1Q9Z2H5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Epb41l1Q9Z2H5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Epb41l1Q9Z2H5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Epb41l1Q9Z2H5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Epb41l1Q9Z2H5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Epb41l1Q9Z2H5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Epb41l1Q9Z2H5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Epb41l1Q9Z2H5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Epb41l1Q9Z2H5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Epb41l1Q9Z2H5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Epb41l1Q9Z2H5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Epb41l1Q9Z2H5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Epb41l1Q9Z2H5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Epb41l1Q9Z2H5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Epb41l1Q9Z2H5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Epb41l1Q9Z2H5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Epb41l1Q9Z2H5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Epb41l1Q9Z2H5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Epb41l1Q9Z2H5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Epb41l1Q9Z2H5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Epb41l1Q9Z2H5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Epb41l1Q9Z2H5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Epb41l1Q9Z2H5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Epb41l1Q9Z2H5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Epb41l1Q9Z2H5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Epb41l1Q9Z2H5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Epb41l1Q9Z2H5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Epb41l1Q9Z2H5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Epb41l1Q9Z2H5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Epb41l1Q9Z2H5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Epb41l1Q9Z2H5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Epb41l1Q9Z2H5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Epb41l1Q9Z2H5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Epb41l1Q9Z2H5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Epb41l1Q9Z2H5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Epb41l1Q9Z2H5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Epb41l1Q9Z2H5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Epb41l1Q9Z2H5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Epb41l1Q9Z2H5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Epb41l1Q9Z2H5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Epb41l1Q9Z2H5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Epb41l1Q9Z2H5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Epb41l1Q9Z2H5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Epb41l1Q9Z2H5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Epb41l1Q9Z2H5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Epb41l1Q9Z2H5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Epb41l1Q9Z2H5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Epb41l1Q9Z2H5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Epb41l1Q9Z2H5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Epb41l1Q9Z2H5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Epb41l1Q9Z2H5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Epb41l1Q9Z2H5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Epb41l1Q9Z2H5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Epb41l1Q9Z2H5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Epb41l1Q9Z2H5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Epb41l1Q9Z2H5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms