Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1R4

D17h6s53e, Uncharacterized protein C6orf47 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D17h6s53eQ9Z1R4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
D17h6s53eQ9Z1R4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
D17h6s53eQ9Z1R4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
D17h6s53eQ9Z1R4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
D17h6s53eQ9Z1R4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
D17h6s53eQ9Z1R4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
D17h6s53eQ9Z1R4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
D17h6s53eQ9Z1R4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
D17h6s53eQ9Z1R4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
D17h6s53eQ9Z1R4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
D17h6s53eQ9Z1R4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
D17h6s53eQ9Z1R4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
D17h6s53eQ9Z1R4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
D17h6s53eQ9Z1R4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
D17h6s53eQ9Z1R4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
D17h6s53eQ9Z1R4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
D17h6s53eQ9Z1R4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
D17h6s53eQ9Z1R4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
D17h6s53eQ9Z1R4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
D17h6s53eQ9Z1R4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
D17h6s53eQ9Z1R4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
D17h6s53eQ9Z1R4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
D17h6s53eQ9Z1R4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
D17h6s53eQ9Z1R4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
D17h6s53eQ9Z1R4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
D17h6s53eQ9Z1R4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
D17h6s53eQ9Z1R4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
D17h6s53eQ9Z1R4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
D17h6s53eQ9Z1R4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
D17h6s53eQ9Z1R4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
D17h6s53eQ9Z1R4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
D17h6s53eQ9Z1R4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
D17h6s53eQ9Z1R4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
D17h6s53eQ9Z1R4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
D17h6s53eQ9Z1R4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
D17h6s53eQ9Z1R4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
D17h6s53eQ9Z1R4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
D17h6s53eQ9Z1R4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
D17h6s53eQ9Z1R4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
D17h6s53eQ9Z1R4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
D17h6s53eQ9Z1R4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
D17h6s53eQ9Z1R4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
D17h6s53eQ9Z1R4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
D17h6s53eQ9Z1R4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
D17h6s53eQ9Z1R4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
D17h6s53eQ9Z1R4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
D17h6s53eQ9Z1R4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
D17h6s53eQ9Z1R4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
D17h6s53eQ9Z1R4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
D17h6s53eQ9Z1R4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
D17h6s53eQ9Z1R4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
D17h6s53eQ9Z1R4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
D17h6s53eQ9Z1R4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
D17h6s53eQ9Z1R4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
D17h6s53eQ9Z1R4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
D17h6s53eQ9Z1R4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
D17h6s53eQ9Z1R4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
D17h6s53eQ9Z1R4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
D17h6s53eQ9Z1R4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
D17h6s53eQ9Z1R4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
D17h6s53eQ9Z1R4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
D17h6s53eQ9Z1R4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
D17h6s53eQ9Z1R4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
D17h6s53eQ9Z1R4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
D17h6s53eQ9Z1R4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
D17h6s53eQ9Z1R4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
D17h6s53eQ9Z1R4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
D17h6s53eQ9Z1R4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
D17h6s53eQ9Z1R4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
D17h6s53eQ9Z1R4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
D17h6s53eQ9Z1R4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
D17h6s53eQ9Z1R4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
D17h6s53eQ9Z1R4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
D17h6s53eQ9Z1R4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms