Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z180

Setbp1, SET-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setbp1Q9Z180 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Setbp1Q9Z180 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Setbp1Q9Z180 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
Setbp1Q9Z180 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
Setbp1Q9Z180 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
Setbp1Q9Z180 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Setbp1Q9Z180 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Setbp1Q9Z180 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC37.46■■■■□ 3.59
Setbp1Q9Z180 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Setbp1Q9Z180 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
Setbp1Q9Z180 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
Setbp1Q9Z180 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Setbp1Q9Z180 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Setbp1Q9Z180 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC37.4■■■■□ 3.58
Setbp1Q9Z180 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Setbp1Q9Z180 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
Setbp1Q9Z180 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC37.38■■■■□ 3.58
Setbp1Q9Z180 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
Setbp1Q9Z180 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Setbp1Q9Z180 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Setbp1Q9Z180 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Setbp1Q9Z180 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
Setbp1Q9Z180 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
Setbp1Q9Z180 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
Setbp1Q9Z180 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
Setbp1Q9Z180 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
Setbp1Q9Z180 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Setbp1Q9Z180 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
Setbp1Q9Z180 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
Setbp1Q9Z180 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
Setbp1Q9Z180 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
Setbp1Q9Z180 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Setbp1Q9Z180 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Setbp1Q9Z180 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
Setbp1Q9Z180 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Setbp1Q9Z180 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Setbp1Q9Z180 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
Setbp1Q9Z180 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Setbp1Q9Z180 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Setbp1Q9Z180 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.56
Setbp1Q9Z180 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
Setbp1Q9Z180 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Setbp1Q9Z180 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Setbp1Q9Z180 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Setbp1Q9Z180 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Setbp1Q9Z180 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
Setbp1Q9Z180 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Setbp1Q9Z180 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
Setbp1Q9Z180 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Setbp1Q9Z180 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
Setbp1Q9Z180 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Setbp1Q9Z180 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Setbp1Q9Z180 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Setbp1Q9Z180 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Setbp1Q9Z180 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Setbp1Q9Z180 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC37.14■■■■□ 3.54
Setbp1Q9Z180 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Setbp1Q9Z180 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Setbp1Q9Z180 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Setbp1Q9Z180 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Setbp1Q9Z180 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Setbp1Q9Z180 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC37.11■■■■□ 3.53
Setbp1Q9Z180 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Setbp1Q9Z180 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Setbp1Q9Z180 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
Setbp1Q9Z180 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Setbp1Q9Z180 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Setbp1Q9Z180 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC37.07■■■■□ 3.52
Setbp1Q9Z180 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Setbp1Q9Z180 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Setbp1Q9Z180 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Setbp1Q9Z180 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
Setbp1Q9Z180 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Setbp1Q9Z180 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
Setbp1Q9Z180 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
Setbp1Q9Z180 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Setbp1Q9Z180 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Setbp1Q9Z180 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC37■■■■□ 3.51
Setbp1Q9Z180 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Setbp1Q9Z180 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Setbp1Q9Z180 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
Setbp1Q9Z180 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Setbp1Q9Z180 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
Setbp1Q9Z180 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
Setbp1Q9Z180 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Setbp1Q9Z180 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
Setbp1Q9Z180 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
Setbp1Q9Z180 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
Setbp1Q9Z180 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Setbp1Q9Z180 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Setbp1Q9Z180 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Setbp1Q9Z180 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
Setbp1Q9Z180 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
Setbp1Q9Z180 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Setbp1Q9Z180 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC36.91■■■■□ 3.5
Setbp1Q9Z180 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
Setbp1Q9Z180 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
Setbp1Q9Z180 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
Setbp1Q9Z180 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Setbp1Q9Z180 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms