Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W1

Ngfr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgfrQ9Z0W1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NgfrQ9Z0W1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NgfrQ9Z0W1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NgfrQ9Z0W1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NgfrQ9Z0W1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
NgfrQ9Z0W1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NgfrQ9Z0W1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NgfrQ9Z0W1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
NgfrQ9Z0W1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NgfrQ9Z0W1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NgfrQ9Z0W1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NgfrQ9Z0W1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NgfrQ9Z0W1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NgfrQ9Z0W1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NgfrQ9Z0W1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NgfrQ9Z0W1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NgfrQ9Z0W1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
NgfrQ9Z0W1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NgfrQ9Z0W1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NgfrQ9Z0W1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NgfrQ9Z0W1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NgfrQ9Z0W1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NgfrQ9Z0W1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NgfrQ9Z0W1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NgfrQ9Z0W1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NgfrQ9Z0W1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
NgfrQ9Z0W1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NgfrQ9Z0W1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NgfrQ9Z0W1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NgfrQ9Z0W1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NgfrQ9Z0W1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NgfrQ9Z0W1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NgfrQ9Z0W1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NgfrQ9Z0W1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NgfrQ9Z0W1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NgfrQ9Z0W1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NgfrQ9Z0W1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NgfrQ9Z0W1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
NgfrQ9Z0W1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NgfrQ9Z0W1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NgfrQ9Z0W1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NgfrQ9Z0W1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NgfrQ9Z0W1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NgfrQ9Z0W1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NgfrQ9Z0W1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NgfrQ9Z0W1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NgfrQ9Z0W1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NgfrQ9Z0W1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NgfrQ9Z0W1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NgfrQ9Z0W1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NgfrQ9Z0W1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NgfrQ9Z0W1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NgfrQ9Z0W1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NgfrQ9Z0W1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NgfrQ9Z0W1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NgfrQ9Z0W1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NgfrQ9Z0W1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
NgfrQ9Z0W1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
NgfrQ9Z0W1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NgfrQ9Z0W1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
NgfrQ9Z0W1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
NgfrQ9Z0W1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NgfrQ9Z0W1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NgfrQ9Z0W1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NgfrQ9Z0W1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NgfrQ9Z0W1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NgfrQ9Z0W1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NgfrQ9Z0W1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NgfrQ9Z0W1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NgfrQ9Z0W1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NgfrQ9Z0W1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NgfrQ9Z0W1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NgfrQ9Z0W1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NgfrQ9Z0W1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NgfrQ9Z0W1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NgfrQ9Z0W1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NgfrQ9Z0W1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NgfrQ9Z0W1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NgfrQ9Z0W1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NgfrQ9Z0W1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NgfrQ9Z0W1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NgfrQ9Z0W1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NgfrQ9Z0W1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NgfrQ9Z0W1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NgfrQ9Z0W1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NgfrQ9Z0W1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NgfrQ9Z0W1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NgfrQ9Z0W1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NgfrQ9Z0W1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NgfrQ9Z0W1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NgfrQ9Z0W1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NgfrQ9Z0W1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NgfrQ9Z0W1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NgfrQ9Z0W1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NgfrQ9Z0W1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
NgfrQ9Z0W1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NgfrQ9Z0W1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NgfrQ9Z0W1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NgfrQ9Z0W1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NgfrQ9Z0W1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms