Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0U0

Xpr1, Xenotropic and polytropic retrovirus receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xpr1Q9Z0U0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Xpr1Q9Z0U0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Xpr1Q9Z0U0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Xpr1Q9Z0U0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Xpr1Q9Z0U0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Xpr1Q9Z0U0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Xpr1Q9Z0U0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Xpr1Q9Z0U0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Xpr1Q9Z0U0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Xpr1Q9Z0U0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Xpr1Q9Z0U0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Xpr1Q9Z0U0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Xpr1Q9Z0U0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Xpr1Q9Z0U0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Xpr1Q9Z0U0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Xpr1Q9Z0U0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Xpr1Q9Z0U0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Xpr1Q9Z0U0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Xpr1Q9Z0U0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Xpr1Q9Z0U0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Xpr1Q9Z0U0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Xpr1Q9Z0U0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Xpr1Q9Z0U0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Xpr1Q9Z0U0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Xpr1Q9Z0U0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Xpr1Q9Z0U0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Xpr1Q9Z0U0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Xpr1Q9Z0U0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Xpr1Q9Z0U0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Xpr1Q9Z0U0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Xpr1Q9Z0U0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Xpr1Q9Z0U0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Xpr1Q9Z0U0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Xpr1Q9Z0U0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Xpr1Q9Z0U0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Xpr1Q9Z0U0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Xpr1Q9Z0U0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Xpr1Q9Z0U0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Xpr1Q9Z0U0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Xpr1Q9Z0U0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Xpr1Q9Z0U0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Xpr1Q9Z0U0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Xpr1Q9Z0U0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Xpr1Q9Z0U0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Xpr1Q9Z0U0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Xpr1Q9Z0U0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Xpr1Q9Z0U0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Xpr1Q9Z0U0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Xpr1Q9Z0U0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Xpr1Q9Z0U0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Xpr1Q9Z0U0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Xpr1Q9Z0U0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Xpr1Q9Z0U0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Xpr1Q9Z0U0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Xpr1Q9Z0U0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Xpr1Q9Z0U0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Xpr1Q9Z0U0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Xpr1Q9Z0U0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Xpr1Q9Z0U0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Xpr1Q9Z0U0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Xpr1Q9Z0U0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Xpr1Q9Z0U0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Xpr1Q9Z0U0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Xpr1Q9Z0U0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Xpr1Q9Z0U0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Xpr1Q9Z0U0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Xpr1Q9Z0U0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Xpr1Q9Z0U0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Xpr1Q9Z0U0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Xpr1Q9Z0U0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Xpr1Q9Z0U0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Xpr1Q9Z0U0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Xpr1Q9Z0U0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Xpr1Q9Z0U0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Xpr1Q9Z0U0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Xpr1Q9Z0U0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Xpr1Q9Z0U0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Xpr1Q9Z0U0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Xpr1Q9Z0U0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Xpr1Q9Z0U0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Xpr1Q9Z0U0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Xpr1Q9Z0U0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Xpr1Q9Z0U0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Xpr1Q9Z0U0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Xpr1Q9Z0U0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Xpr1Q9Z0U0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Xpr1Q9Z0U0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Xpr1Q9Z0U0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Xpr1Q9Z0U0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Xpr1Q9Z0U0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Xpr1Q9Z0U0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Xpr1Q9Z0U0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Xpr1Q9Z0U0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Xpr1Q9Z0U0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Xpr1Q9Z0U0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Xpr1Q9Z0U0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Xpr1Q9Z0U0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Xpr1Q9Z0U0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Xpr1Q9Z0U0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Xpr1Q9Z0U0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms