Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0G9

Cldn3, Claudin-3, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn3Q9Z0G9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cldn3Q9Z0G9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cldn3Q9Z0G9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cldn3Q9Z0G9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cldn3Q9Z0G9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cldn3Q9Z0G9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cldn3Q9Z0G9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cldn3Q9Z0G9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cldn3Q9Z0G9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cldn3Q9Z0G9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cldn3Q9Z0G9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cldn3Q9Z0G9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cldn3Q9Z0G9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cldn3Q9Z0G9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cldn3Q9Z0G9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cldn3Q9Z0G9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Cldn3Q9Z0G9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cldn3Q9Z0G9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cldn3Q9Z0G9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cldn3Q9Z0G9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cldn3Q9Z0G9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cldn3Q9Z0G9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cldn3Q9Z0G9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cldn3Q9Z0G9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cldn3Q9Z0G9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cldn3Q9Z0G9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cldn3Q9Z0G9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cldn3Q9Z0G9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cldn3Q9Z0G9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cldn3Q9Z0G9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cldn3Q9Z0G9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cldn3Q9Z0G9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cldn3Q9Z0G9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cldn3Q9Z0G9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cldn3Q9Z0G9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cldn3Q9Z0G9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cldn3Q9Z0G9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cldn3Q9Z0G9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cldn3Q9Z0G9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cldn3Q9Z0G9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cldn3Q9Z0G9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cldn3Q9Z0G9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cldn3Q9Z0G9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cldn3Q9Z0G9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cldn3Q9Z0G9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cldn3Q9Z0G9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cldn3Q9Z0G9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cldn3Q9Z0G9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cldn3Q9Z0G9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cldn3Q9Z0G9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cldn3Q9Z0G9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cldn3Q9Z0G9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Cldn3Q9Z0G9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cldn3Q9Z0G9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cldn3Q9Z0G9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cldn3Q9Z0G9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cldn3Q9Z0G9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cldn3Q9Z0G9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cldn3Q9Z0G9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cldn3Q9Z0G9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cldn3Q9Z0G9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cldn3Q9Z0G9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cldn3Q9Z0G9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cldn3Q9Z0G9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cldn3Q9Z0G9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cldn3Q9Z0G9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cldn3Q9Z0G9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cldn3Q9Z0G9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cldn3Q9Z0G9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cldn3Q9Z0G9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cldn3Q9Z0G9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Cldn3Q9Z0G9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cldn3Q9Z0G9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cldn3Q9Z0G9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cldn3Q9Z0G9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cldn3Q9Z0G9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cldn3Q9Z0G9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cldn3Q9Z0G9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cldn3Q9Z0G9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Cldn3Q9Z0G9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Cldn3Q9Z0G9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cldn3Q9Z0G9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cldn3Q9Z0G9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cldn3Q9Z0G9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cldn3Q9Z0G9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cldn3Q9Z0G9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cldn3Q9Z0G9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cldn3Q9Z0G9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cldn3Q9Z0G9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cldn3Q9Z0G9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cldn3Q9Z0G9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cldn3Q9Z0G9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cldn3Q9Z0G9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cldn3Q9Z0G9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cldn3Q9Z0G9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cldn3Q9Z0G9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cldn3Q9Z0G9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cldn3Q9Z0G9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cldn3Q9Z0G9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cldn3Q9Z0G9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms