Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E6

Gbp2, Guanylate-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp2Q9Z0E6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24,23■■□□□ 1,47
Gbp2Q9Z0E6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,23■■□□□ 1,47
Gbp2Q9Z0E6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,23■■□□□ 1,47
Gbp2Q9Z0E6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,22■■□□□ 1,47
Gbp2Q9Z0E6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24,22■■□□□ 1,47
Gbp2Q9Z0E6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24,22■■□□□ 1,47
Gbp2Q9Z0E6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,22■■□□□ 1,47
Gbp2Q9Z0E6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,21■■□□□ 1,47
Gbp2Q9Z0E6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,21■■□□□ 1,47
Gbp2Q9Z0E6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,2■■□□□ 1,46
Gbp2Q9Z0E6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,2■■□□□ 1,46
Gbp2Q9Z0E6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,2■■□□□ 1,46
Gbp2Q9Z0E6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24,19■■□□□ 1,46
Gbp2Q9Z0E6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,19■■□□□ 1,46
Gbp2Q9Z0E6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24,19■■□□□ 1,46
Gbp2Q9Z0E6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,19■■□□□ 1,46
Gbp2Q9Z0E6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,18■■□□□ 1,46
Gbp2Q9Z0E6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24,18■■□□□ 1,46
Gbp2Q9Z0E6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24,18■■□□□ 1,46
Gbp2Q9Z0E6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24,17■■□□□ 1,46
Gbp2Q9Z0E6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24,17■■□□□ 1,46
Gbp2Q9Z0E6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,16■■□□□ 1,46
Gbp2Q9Z0E6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24,16■■□□□ 1,46
Gbp2Q9Z0E6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,15■■□□□ 1,46
Gbp2Q9Z0E6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,15■■□□□ 1,46
Gbp2Q9Z0E6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24,14■■□□□ 1,46
Gbp2Q9Z0E6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,14■■□□□ 1,45
Gbp2Q9Z0E6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24,14■■□□□ 1,45
Gbp2Q9Z0E6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24,14■■□□□ 1,45
Gbp2Q9Z0E6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24,13■■□□□ 1,45
Gbp2Q9Z0E6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,12■■□□□ 1,45
Gbp2Q9Z0E6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,12■■□□□ 1,45
Gbp2Q9Z0E6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,11■■□□□ 1,45
Gbp2Q9Z0E6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24,1■■□□□ 1,45
Gbp2Q9Z0E6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24,1■■□□□ 1,45
Gbp2Q9Z0E6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24,1■■□□□ 1,45
Gbp2Q9Z0E6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24,1■■□□□ 1,45
Gbp2Q9Z0E6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,09■■□□□ 1,45
Gbp2Q9Z0E6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,09■■□□□ 1,45
Gbp2Q9Z0E6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,08■■□□□ 1,45
Gbp2Q9Z0E6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,07■■□□□ 1,44
Gbp2Q9Z0E6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24,06■■□□□ 1,44
Gbp2Q9Z0E6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,06■■□□□ 1,44
Gbp2Q9Z0E6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24,06■■□□□ 1,44
Gbp2Q9Z0E6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,06■■□□□ 1,44
Gbp2Q9Z0E6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24,05■■□□□ 1,44
Gbp2Q9Z0E6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24,05■■□□□ 1,44
Gbp2Q9Z0E6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,05■■□□□ 1,44
Gbp2Q9Z0E6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24,05■■□□□ 1,44
Gbp2Q9Z0E6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24,05■■□□□ 1,44
Gbp2Q9Z0E6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24,05■■□□□ 1,44
Gbp2Q9Z0E6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24,05■■□□□ 1,44
Gbp2Q9Z0E6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24,04■■□□□ 1,44
Gbp2Q9Z0E6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24,04■■□□□ 1,44
Gbp2Q9Z0E6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,04■■□□□ 1,44
Gbp2Q9Z0E6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24,04■■□□□ 1,44
Gbp2Q9Z0E6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,03■■□□□ 1,44
Gbp2Q9Z0E6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24,03■■□□□ 1,44
Gbp2Q9Z0E6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,03■■□□□ 1,44
Gbp2Q9Z0E6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,03■■□□□ 1,44
Gbp2Q9Z0E6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24,02■■□□□ 1,44
Gbp2Q9Z0E6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,02■■□□□ 1,44
Gbp2Q9Z0E6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24,02■■□□□ 1,44
Gbp2Q9Z0E6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24,02■■□□□ 1,44
Gbp2Q9Z0E6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,02■■□□□ 1,44
Gbp2Q9Z0E6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,02■■□□□ 1,44
Gbp2Q9Z0E6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24,02■■□□□ 1,44
Gbp2Q9Z0E6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24,01■■□□□ 1,43
Gbp2Q9Z0E6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,01■■□□□ 1,43
Gbp2Q9Z0E6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24,01■■□□□ 1,43
Gbp2Q9Z0E6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24,01■■□□□ 1,43
Gbp2Q9Z0E6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1,43
Gbp2Q9Z0E6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1,43
Gbp2Q9Z0E6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1,43
Gbp2Q9Z0E6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1,43
Gbp2Q9Z0E6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1,43
Gbp2Q9Z0E6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,99■■□□□ 1,43
Gbp2Q9Z0E6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,99■■□□□ 1,43
Gbp2Q9Z0E6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,99■■□□□ 1,43
Gbp2Q9Z0E6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23,99■■□□□ 1,43
Gbp2Q9Z0E6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23,99■■□□□ 1,43
Gbp2Q9Z0E6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,98■■□□□ 1,43
Gbp2Q9Z0E6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23,98■■□□□ 1,43
Gbp2Q9Z0E6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,98■■□□□ 1,43
Gbp2Q9Z0E6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23,97■■□□□ 1,43
Gbp2Q9Z0E6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,97■■□□□ 1,43
Gbp2Q9Z0E6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23,96■■□□□ 1,43
Gbp2Q9Z0E6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,96■■□□□ 1,43
Gbp2Q9Z0E6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,95■■□□□ 1,42
Gbp2Q9Z0E6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23,95■■□□□ 1,42
Gbp2Q9Z0E6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23,95■■□□□ 1,42
Gbp2Q9Z0E6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,95■■□□□ 1,42
Gbp2Q9Z0E6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,94■■□□□ 1,42
Gbp2Q9Z0E6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,94■■□□□ 1,42
Gbp2Q9Z0E6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,94■■□□□ 1,42
Gbp2Q9Z0E6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23,94■■□□□ 1,42
Gbp2Q9Z0E6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,94■■□□□ 1,42
Gbp2Q9Z0E6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23,94■■□□□ 1,42
Gbp2Q9Z0E6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23,93■■□□□ 1,42
Gbp2Q9Z0E6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,93■■□□□ 1,42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77,4 ms