Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUK7

Opn3, Opsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn3Q9WUK7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Opn3Q9WUK7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Opn3Q9WUK7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Opn3Q9WUK7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Opn3Q9WUK7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Opn3Q9WUK7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Opn3Q9WUK7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Opn3Q9WUK7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Opn3Q9WUK7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Opn3Q9WUK7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Opn3Q9WUK7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Opn3Q9WUK7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Opn3Q9WUK7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Opn3Q9WUK7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Opn3Q9WUK7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Opn3Q9WUK7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Opn3Q9WUK7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Opn3Q9WUK7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Opn3Q9WUK7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Opn3Q9WUK7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Opn3Q9WUK7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Opn3Q9WUK7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Opn3Q9WUK7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Opn3Q9WUK7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Opn3Q9WUK7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Opn3Q9WUK7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Opn3Q9WUK7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Opn3Q9WUK7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Opn3Q9WUK7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Opn3Q9WUK7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Opn3Q9WUK7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Opn3Q9WUK7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Opn3Q9WUK7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Opn3Q9WUK7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Opn3Q9WUK7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Opn3Q9WUK7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Opn3Q9WUK7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Opn3Q9WUK7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Opn3Q9WUK7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Opn3Q9WUK7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Opn3Q9WUK7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Opn3Q9WUK7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Opn3Q9WUK7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Opn3Q9WUK7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Opn3Q9WUK7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Opn3Q9WUK7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Opn3Q9WUK7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Opn3Q9WUK7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Opn3Q9WUK7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Opn3Q9WUK7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Opn3Q9WUK7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Opn3Q9WUK7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Opn3Q9WUK7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Opn3Q9WUK7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Opn3Q9WUK7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Opn3Q9WUK7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Opn3Q9WUK7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Opn3Q9WUK7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Opn3Q9WUK7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Opn3Q9WUK7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Opn3Q9WUK7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Opn3Q9WUK7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Opn3Q9WUK7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Opn3Q9WUK7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Opn3Q9WUK7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Opn3Q9WUK7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Opn3Q9WUK7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Opn3Q9WUK7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Opn3Q9WUK7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Opn3Q9WUK7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Opn3Q9WUK7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Opn3Q9WUK7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Opn3Q9WUK7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Opn3Q9WUK7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Opn3Q9WUK7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Opn3Q9WUK7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Opn3Q9WUK7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Opn3Q9WUK7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Opn3Q9WUK7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Opn3Q9WUK7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Opn3Q9WUK7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Opn3Q9WUK7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Opn3Q9WUK7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Opn3Q9WUK7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Opn3Q9WUK7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Opn3Q9WUK7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Opn3Q9WUK7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Opn3Q9WUK7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Opn3Q9WUK7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Opn3Q9WUK7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Opn3Q9WUK7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Opn3Q9WUK7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Opn3Q9WUK7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Opn3Q9WUK7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Opn3Q9WUK7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Opn3Q9WUK7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Opn3Q9WUK7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Opn3Q9WUK7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Opn3Q9WUK7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Opn3Q9WUK7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms