Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp18Q9WTV6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp18Q9WTV6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp18Q9WTV6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp18Q9WTV6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp18Q9WTV6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp18Q9WTV6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp18Q9WTV6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp18Q9WTV6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp18Q9WTV6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp18Q9WTV6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp18Q9WTV6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp18Q9WTV6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp18Q9WTV6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp18Q9WTV6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp18Q9WTV6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp18Q9WTV6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp18Q9WTV6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp18Q9WTV6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp18Q9WTV6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp18Q9WTV6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp18Q9WTV6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp18Q9WTV6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp18Q9WTV6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp18Q9WTV6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp18Q9WTV6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp18Q9WTV6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp18Q9WTV6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp18Q9WTV6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp18Q9WTV6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp18Q9WTV6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp18Q9WTV6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp18Q9WTV6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp18Q9WTV6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp18Q9WTV6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Usp18Q9WTV6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp18Q9WTV6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp18Q9WTV6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp18Q9WTV6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp18Q9WTV6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp18Q9WTV6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp18Q9WTV6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp18Q9WTV6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp18Q9WTV6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp18Q9WTV6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp18Q9WTV6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp18Q9WTV6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp18Q9WTV6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp18Q9WTV6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp18Q9WTV6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp18Q9WTV6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp18Q9WTV6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp18Q9WTV6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp18Q9WTV6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp18Q9WTV6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp18Q9WTV6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp18Q9WTV6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp18Q9WTV6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp18Q9WTV6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp18Q9WTV6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp18Q9WTV6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Usp18Q9WTV6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Usp18Q9WTV6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp18Q9WTV6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Usp18Q9WTV6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp18Q9WTV6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp18Q9WTV6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp18Q9WTV6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp18Q9WTV6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp18Q9WTV6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp18Q9WTV6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp18Q9WTV6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp18Q9WTV6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp18Q9WTV6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp18Q9WTV6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp18Q9WTV6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp18Q9WTV6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp18Q9WTV6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp18Q9WTV6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp18Q9WTV6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp18Q9WTV6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp18Q9WTV6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp18Q9WTV6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp18Q9WTV6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp18Q9WTV6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp18Q9WTV6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp18Q9WTV6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp18Q9WTV6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp18Q9WTV6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp18Q9WTV6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp18Q9WTV6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp18Q9WTV6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp18Q9WTV6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp18Q9WTV6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp18Q9WTV6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp18Q9WTV6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp18Q9WTV6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp18Q9WTV6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp18Q9WTV6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp18Q9WTV6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms