Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL0

Ripk3, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk3Q9QZL0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ripk3Q9QZL0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ripk3Q9QZL0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ripk3Q9QZL0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ripk3Q9QZL0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ripk3Q9QZL0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ripk3Q9QZL0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Ripk3Q9QZL0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Ripk3Q9QZL0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ripk3Q9QZL0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ripk3Q9QZL0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ripk3Q9QZL0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ripk3Q9QZL0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ripk3Q9QZL0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ripk3Q9QZL0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ripk3Q9QZL0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Ripk3Q9QZL0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ripk3Q9QZL0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ripk3Q9QZL0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Ripk3Q9QZL0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Ripk3Q9QZL0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Ripk3Q9QZL0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ripk3Q9QZL0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ripk3Q9QZL0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ripk3Q9QZL0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ripk3Q9QZL0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ripk3Q9QZL0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Ripk3Q9QZL0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ripk3Q9QZL0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ripk3Q9QZL0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ripk3Q9QZL0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ripk3Q9QZL0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ripk3Q9QZL0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ripk3Q9QZL0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ripk3Q9QZL0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ripk3Q9QZL0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ripk3Q9QZL0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ripk3Q9QZL0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ripk3Q9QZL0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ripk3Q9QZL0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ripk3Q9QZL0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ripk3Q9QZL0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ripk3Q9QZL0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ripk3Q9QZL0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ripk3Q9QZL0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Ripk3Q9QZL0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ripk3Q9QZL0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ripk3Q9QZL0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ripk3Q9QZL0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ripk3Q9QZL0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Ripk3Q9QZL0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ripk3Q9QZL0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ripk3Q9QZL0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Ripk3Q9QZL0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ripk3Q9QZL0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ripk3Q9QZL0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ripk3Q9QZL0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ripk3Q9QZL0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ripk3Q9QZL0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ripk3Q9QZL0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ripk3Q9QZL0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ripk3Q9QZL0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ripk3Q9QZL0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ripk3Q9QZL0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ripk3Q9QZL0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Ripk3Q9QZL0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ripk3Q9QZL0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ripk3Q9QZL0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ripk3Q9QZL0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ripk3Q9QZL0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ripk3Q9QZL0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ripk3Q9QZL0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ripk3Q9QZL0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ripk3Q9QZL0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ripk3Q9QZL0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ripk3Q9QZL0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ripk3Q9QZL0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ripk3Q9QZL0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Ripk3Q9QZL0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ripk3Q9QZL0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ripk3Q9QZL0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ripk3Q9QZL0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ripk3Q9QZL0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ripk3Q9QZL0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ripk3Q9QZL0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ripk3Q9QZL0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ripk3Q9QZL0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ripk3Q9QZL0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ripk3Q9QZL0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ripk3Q9QZL0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ripk3Q9QZL0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Ripk3Q9QZL0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ripk3Q9QZL0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ripk3Q9QZL0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ripk3Q9QZL0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Ripk3Q9QZL0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ripk3Q9QZL0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ripk3Q9QZL0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Ripk3Q9QZL0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ripk3Q9QZL0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms