Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Copg1Q9QZE5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Copg1Q9QZE5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Copg1Q9QZE5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Copg1Q9QZE5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Copg1Q9QZE5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Copg1Q9QZE5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Copg1Q9QZE5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Copg1Q9QZE5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Copg1Q9QZE5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Copg1Q9QZE5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Copg1Q9QZE5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Copg1Q9QZE5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Copg1Q9QZE5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Copg1Q9QZE5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Copg1Q9QZE5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Copg1Q9QZE5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Copg1Q9QZE5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Copg1Q9QZE5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Copg1Q9QZE5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Copg1Q9QZE5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Copg1Q9QZE5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Copg1Q9QZE5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Copg1Q9QZE5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Copg1Q9QZE5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Copg1Q9QZE5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Copg1Q9QZE5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Copg1Q9QZE5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Copg1Q9QZE5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Copg1Q9QZE5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Copg1Q9QZE5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Copg1Q9QZE5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Copg1Q9QZE5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Copg1Q9QZE5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Copg1Q9QZE5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Copg1Q9QZE5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Copg1Q9QZE5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Copg1Q9QZE5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Copg1Q9QZE5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Copg1Q9QZE5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Copg1Q9QZE5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Copg1Q9QZE5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Copg1Q9QZE5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Copg1Q9QZE5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Copg1Q9QZE5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Copg1Q9QZE5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Copg1Q9QZE5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Copg1Q9QZE5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Copg1Q9QZE5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Copg1Q9QZE5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Copg1Q9QZE5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Copg1Q9QZE5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Copg1Q9QZE5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Copg1Q9QZE5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Copg1Q9QZE5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Copg1Q9QZE5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Copg1Q9QZE5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Copg1Q9QZE5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Copg1Q9QZE5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Copg1Q9QZE5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Copg1Q9QZE5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Copg1Q9QZE5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Copg1Q9QZE5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Copg1Q9QZE5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Copg1Q9QZE5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Copg1Q9QZE5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Copg1Q9QZE5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Copg1Q9QZE5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Copg1Q9QZE5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Copg1Q9QZE5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Copg1Q9QZE5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Copg1Q9QZE5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Copg1Q9QZE5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Copg1Q9QZE5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Copg1Q9QZE5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Copg1Q9QZE5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Copg1Q9QZE5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Copg1Q9QZE5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Copg1Q9QZE5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Copg1Q9QZE5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Copg1Q9QZE5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Copg1Q9QZE5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Copg1Q9QZE5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Copg1Q9QZE5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Copg1Q9QZE5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Copg1Q9QZE5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Copg1Q9QZE5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Copg1Q9QZE5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Copg1Q9QZE5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Copg1Q9QZE5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Copg1Q9QZE5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Copg1Q9QZE5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Copg1Q9QZE5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Copg1Q9QZE5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Copg1Q9QZE5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Copg1Q9QZE5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Copg1Q9QZE5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Copg1Q9QZE5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Copg1Q9QZE5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Copg1Q9QZE5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms