Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ57

Hspb3, Heat shock protein beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hspb3Q9QZ57 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hspb3Q9QZ57 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hspb3Q9QZ57 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hspb3Q9QZ57 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hspb3Q9QZ57 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hspb3Q9QZ57 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hspb3Q9QZ57 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hspb3Q9QZ57 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hspb3Q9QZ57 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hspb3Q9QZ57 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hspb3Q9QZ57 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hspb3Q9QZ57 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hspb3Q9QZ57 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hspb3Q9QZ57 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hspb3Q9QZ57 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hspb3Q9QZ57 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hspb3Q9QZ57 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hspb3Q9QZ57 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hspb3Q9QZ57 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hspb3Q9QZ57 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hspb3Q9QZ57 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hspb3Q9QZ57 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hspb3Q9QZ57 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hspb3Q9QZ57 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hspb3Q9QZ57 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hspb3Q9QZ57 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hspb3Q9QZ57 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hspb3Q9QZ57 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Hspb3Q9QZ57 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hspb3Q9QZ57 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hspb3Q9QZ57 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hspb3Q9QZ57 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hspb3Q9QZ57 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hspb3Q9QZ57 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hspb3Q9QZ57 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hspb3Q9QZ57 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hspb3Q9QZ57 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hspb3Q9QZ57 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hspb3Q9QZ57 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hspb3Q9QZ57 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hspb3Q9QZ57 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hspb3Q9QZ57 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hspb3Q9QZ57 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hspb3Q9QZ57 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hspb3Q9QZ57 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hspb3Q9QZ57 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hspb3Q9QZ57 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hspb3Q9QZ57 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hspb3Q9QZ57 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Hspb3Q9QZ57 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hspb3Q9QZ57 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hspb3Q9QZ57 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hspb3Q9QZ57 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hspb3Q9QZ57 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Hspb3Q9QZ57 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hspb3Q9QZ57 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hspb3Q9QZ57 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hspb3Q9QZ57 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hspb3Q9QZ57 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hspb3Q9QZ57 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hspb3Q9QZ57 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hspb3Q9QZ57 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hspb3Q9QZ57 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hspb3Q9QZ57 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hspb3Q9QZ57 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hspb3Q9QZ57 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hspb3Q9QZ57 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hspb3Q9QZ57 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hspb3Q9QZ57 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hspb3Q9QZ57 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Hspb3Q9QZ57 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hspb3Q9QZ57 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hspb3Q9QZ57 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hspb3Q9QZ57 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hspb3Q9QZ57 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Hspb3Q9QZ57 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hspb3Q9QZ57 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hspb3Q9QZ57 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hspb3Q9QZ57 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Hspb3Q9QZ57 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Hspb3Q9QZ57 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hspb3Q9QZ57 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hspb3Q9QZ57 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hspb3Q9QZ57 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hspb3Q9QZ57 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hspb3Q9QZ57 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hspb3Q9QZ57 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hspb3Q9QZ57 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hspb3Q9QZ57 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hspb3Q9QZ57 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hspb3Q9QZ57 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Hspb3Q9QZ57 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hspb3Q9QZ57 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hspb3Q9QZ57 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hspb3Q9QZ57 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hspb3Q9QZ57 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hspb3Q9QZ57 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hspb3Q9QZ57 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hspb3Q9QZ57 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hspb3Q9QZ57 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms