Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Six6Q9QZ28 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Six6Q9QZ28 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Six6Q9QZ28 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Six6Q9QZ28 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Six6Q9QZ28 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Six6Q9QZ28 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Six6Q9QZ28 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Six6Q9QZ28 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Six6Q9QZ28 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Six6Q9QZ28 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Six6Q9QZ28 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Six6Q9QZ28 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Six6Q9QZ28 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Six6Q9QZ28 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Six6Q9QZ28 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Six6Q9QZ28 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Six6Q9QZ28 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Six6Q9QZ28 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Six6Q9QZ28 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Six6Q9QZ28 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Six6Q9QZ28 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Six6Q9QZ28 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Six6Q9QZ28 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Six6Q9QZ28 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Six6Q9QZ28 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Six6Q9QZ28 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Six6Q9QZ28 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Six6Q9QZ28 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Six6Q9QZ28 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Six6Q9QZ28 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Six6Q9QZ28 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Six6Q9QZ28 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Six6Q9QZ28 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Six6Q9QZ28 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Six6Q9QZ28 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Six6Q9QZ28 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Six6Q9QZ28 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Six6Q9QZ28 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Six6Q9QZ28 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Six6Q9QZ28 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Six6Q9QZ28 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Six6Q9QZ28 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Six6Q9QZ28 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Six6Q9QZ28 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Six6Q9QZ28 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Six6Q9QZ28 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Six6Q9QZ28 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Six6Q9QZ28 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Six6Q9QZ28 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Six6Q9QZ28 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Six6Q9QZ28 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Six6Q9QZ28 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Six6Q9QZ28 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Six6Q9QZ28 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Six6Q9QZ28 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Six6Q9QZ28 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Six6Q9QZ28 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Six6Q9QZ28 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Six6Q9QZ28 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Six6Q9QZ28 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Six6Q9QZ28 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Six6Q9QZ28 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Six6Q9QZ28 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Six6Q9QZ28 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Six6Q9QZ28 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Six6Q9QZ28 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Six6Q9QZ28 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Six6Q9QZ28 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Six6Q9QZ28 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Six6Q9QZ28 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Six6Q9QZ28 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Six6Q9QZ28 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Six6Q9QZ28 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Six6Q9QZ28 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Six6Q9QZ28 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Six6Q9QZ28 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Six6Q9QZ28 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Six6Q9QZ28 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Six6Q9QZ28 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Six6Q9QZ28 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Six6Q9QZ28 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Six6Q9QZ28 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Six6Q9QZ28 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Six6Q9QZ28 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Six6Q9QZ28 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Six6Q9QZ28 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Six6Q9QZ28 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Six6Q9QZ28 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Six6Q9QZ28 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Six6Q9QZ28 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Six6Q9QZ28 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Six6Q9QZ28 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Six6Q9QZ28 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Six6Q9QZ28 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Six6Q9QZ28 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Six6Q9QZ28 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Six6Q9QZ28 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Six6Q9QZ28 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Six6Q9QZ28 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms