Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ11

Exo1, Exonuclease 1, mousemouse

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Length 837 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo1Q9QZ11 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Exo1Q9QZ11 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Exo1Q9QZ11 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Exo1Q9QZ11 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Exo1Q9QZ11 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Exo1Q9QZ11 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Exo1Q9QZ11 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Exo1Q9QZ11 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Exo1Q9QZ11 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Exo1Q9QZ11 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Exo1Q9QZ11 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Exo1Q9QZ11 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Exo1Q9QZ11 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Exo1Q9QZ11 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Exo1Q9QZ11 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Exo1Q9QZ11 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Exo1Q9QZ11 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Exo1Q9QZ11 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Exo1Q9QZ11 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Exo1Q9QZ11 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Exo1Q9QZ11 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Exo1Q9QZ11 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Exo1Q9QZ11 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Exo1Q9QZ11 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Exo1Q9QZ11 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Exo1Q9QZ11 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Exo1Q9QZ11 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Exo1Q9QZ11 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Exo1Q9QZ11 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Exo1Q9QZ11 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Exo1Q9QZ11 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Exo1Q9QZ11 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Exo1Q9QZ11 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Exo1Q9QZ11 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Exo1Q9QZ11 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Exo1Q9QZ11 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Exo1Q9QZ11 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Exo1Q9QZ11 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Exo1Q9QZ11 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Exo1Q9QZ11 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Exo1Q9QZ11 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Exo1Q9QZ11 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Exo1Q9QZ11 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Exo1Q9QZ11 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Exo1Q9QZ11 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Exo1Q9QZ11 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Exo1Q9QZ11 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Exo1Q9QZ11 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Exo1Q9QZ11 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Exo1Q9QZ11 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Exo1Q9QZ11 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Exo1Q9QZ11 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Exo1Q9QZ11 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Exo1Q9QZ11 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Exo1Q9QZ11 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Exo1Q9QZ11 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Exo1Q9QZ11 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Exo1Q9QZ11 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Exo1Q9QZ11 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Exo1Q9QZ11 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Exo1Q9QZ11 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Exo1Q9QZ11 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Exo1Q9QZ11 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Exo1Q9QZ11 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Exo1Q9QZ11 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Exo1Q9QZ11 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Exo1Q9QZ11 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Exo1Q9QZ11 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Exo1Q9QZ11 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Exo1Q9QZ11 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Exo1Q9QZ11 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Exo1Q9QZ11 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Exo1Q9QZ11 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Exo1Q9QZ11 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Exo1Q9QZ11 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Exo1Q9QZ11 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Exo1Q9QZ11 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Exo1Q9QZ11 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Exo1Q9QZ11 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Exo1Q9QZ11 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Exo1Q9QZ11 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Exo1Q9QZ11 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Exo1Q9QZ11 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Exo1Q9QZ11 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Exo1Q9QZ11 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Exo1Q9QZ11 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Exo1Q9QZ11 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Exo1Q9QZ11 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Exo1Q9QZ11 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Exo1Q9QZ11 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Exo1Q9QZ11 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Exo1Q9QZ11 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Exo1Q9QZ11 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Exo1Q9QZ11 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Exo1Q9QZ11 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Exo1Q9QZ11 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Exo1Q9QZ11 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Exo1Q9QZ11 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Exo1Q9QZ11 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Exo1Q9QZ11 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms