Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Phtf1Q9QZ09 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Phtf1Q9QZ09 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Phtf1Q9QZ09 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Phtf1Q9QZ09 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Phtf1Q9QZ09 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Phtf1Q9QZ09 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Phtf1Q9QZ09 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Phtf1Q9QZ09 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Phtf1Q9QZ09 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Phtf1Q9QZ09 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Phtf1Q9QZ09 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Phtf1Q9QZ09 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Phtf1Q9QZ09 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Phtf1Q9QZ09 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Phtf1Q9QZ09 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Phtf1Q9QZ09 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Phtf1Q9QZ09 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Phtf1Q9QZ09 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Phtf1Q9QZ09 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Phtf1Q9QZ09 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Phtf1Q9QZ09 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Phtf1Q9QZ09 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Phtf1Q9QZ09 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Phtf1Q9QZ09 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Phtf1Q9QZ09 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Phtf1Q9QZ09 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Phtf1Q9QZ09 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Phtf1Q9QZ09 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Phtf1Q9QZ09 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Phtf1Q9QZ09 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Phtf1Q9QZ09 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Phtf1Q9QZ09 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Phtf1Q9QZ09 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Phtf1Q9QZ09 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Phtf1Q9QZ09 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Phtf1Q9QZ09 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Phtf1Q9QZ09 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Phtf1Q9QZ09 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Phtf1Q9QZ09 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Phtf1Q9QZ09 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Phtf1Q9QZ09 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Phtf1Q9QZ09 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Phtf1Q9QZ09 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Phtf1Q9QZ09 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Phtf1Q9QZ09 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Phtf1Q9QZ09 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Phtf1Q9QZ09 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Phtf1Q9QZ09 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Phtf1Q9QZ09 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Phtf1Q9QZ09 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Phtf1Q9QZ09 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Phtf1Q9QZ09 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Phtf1Q9QZ09 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Phtf1Q9QZ09 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Phtf1Q9QZ09 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Phtf1Q9QZ09 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Phtf1Q9QZ09 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Phtf1Q9QZ09 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Phtf1Q9QZ09 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Phtf1Q9QZ09 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Phtf1Q9QZ09 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Phtf1Q9QZ09 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Phtf1Q9QZ09 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Phtf1Q9QZ09 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Phtf1Q9QZ09 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Phtf1Q9QZ09 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Phtf1Q9QZ09 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Phtf1Q9QZ09 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Phtf1Q9QZ09 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Phtf1Q9QZ09 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Phtf1Q9QZ09 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Phtf1Q9QZ09 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Phtf1Q9QZ09 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Phtf1Q9QZ09 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Phtf1Q9QZ09 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Phtf1Q9QZ09 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Phtf1Q9QZ09 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Phtf1Q9QZ09 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Phtf1Q9QZ09 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Phtf1Q9QZ09 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Phtf1Q9QZ09 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Phtf1Q9QZ09 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Phtf1Q9QZ09 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Phtf1Q9QZ09 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Phtf1Q9QZ09 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Phtf1Q9QZ09 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Phtf1Q9QZ09 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Phtf1Q9QZ09 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Phtf1Q9QZ09 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Phtf1Q9QZ09 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Phtf1Q9QZ09 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Phtf1Q9QZ09 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Phtf1Q9QZ09 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Phtf1Q9QZ09 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Phtf1Q9QZ09 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Phtf1Q9QZ09 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Phtf1Q9QZ09 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Phtf1Q9QZ09 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Phtf1Q9QZ09 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms