Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ03

Slc39a1, Zinc transporter ZIP1, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc39a1Q9QZ03 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Slc39a1Q9QZ03 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc39a1Q9QZ03 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc39a1Q9QZ03 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc39a1Q9QZ03 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc39a1Q9QZ03 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc39a1Q9QZ03 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc39a1Q9QZ03 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc39a1Q9QZ03 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc39a1Q9QZ03 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc39a1Q9QZ03 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc39a1Q9QZ03 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc39a1Q9QZ03 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc39a1Q9QZ03 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc39a1Q9QZ03 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc39a1Q9QZ03 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc39a1Q9QZ03 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc39a1Q9QZ03 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc39a1Q9QZ03 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc39a1Q9QZ03 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc39a1Q9QZ03 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc39a1Q9QZ03 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Slc39a1Q9QZ03 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc39a1Q9QZ03 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc39a1Q9QZ03 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc39a1Q9QZ03 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc39a1Q9QZ03 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc39a1Q9QZ03 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc39a1Q9QZ03 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc39a1Q9QZ03 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc39a1Q9QZ03 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc39a1Q9QZ03 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc39a1Q9QZ03 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc39a1Q9QZ03 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc39a1Q9QZ03 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc39a1Q9QZ03 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc39a1Q9QZ03 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc39a1Q9QZ03 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc39a1Q9QZ03 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc39a1Q9QZ03 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc39a1Q9QZ03 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc39a1Q9QZ03 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc39a1Q9QZ03 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc39a1Q9QZ03 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc39a1Q9QZ03 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc39a1Q9QZ03 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc39a1Q9QZ03 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc39a1Q9QZ03 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc39a1Q9QZ03 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc39a1Q9QZ03 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc39a1Q9QZ03 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc39a1Q9QZ03 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc39a1Q9QZ03 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc39a1Q9QZ03 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc39a1Q9QZ03 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc39a1Q9QZ03 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc39a1Q9QZ03 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc39a1Q9QZ03 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc39a1Q9QZ03 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc39a1Q9QZ03 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc39a1Q9QZ03 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc39a1Q9QZ03 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc39a1Q9QZ03 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc39a1Q9QZ03 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc39a1Q9QZ03 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc39a1Q9QZ03 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc39a1Q9QZ03 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc39a1Q9QZ03 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc39a1Q9QZ03 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc39a1Q9QZ03 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc39a1Q9QZ03 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc39a1Q9QZ03 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc39a1Q9QZ03 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc39a1Q9QZ03 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc39a1Q9QZ03 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc39a1Q9QZ03 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc39a1Q9QZ03 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc39a1Q9QZ03 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc39a1Q9QZ03 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc39a1Q9QZ03 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc39a1Q9QZ03 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc39a1Q9QZ03 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc39a1Q9QZ03 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc39a1Q9QZ03 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc39a1Q9QZ03 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc39a1Q9QZ03 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc39a1Q9QZ03 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc39a1Q9QZ03 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc39a1Q9QZ03 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc39a1Q9QZ03 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc39a1Q9QZ03 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc39a1Q9QZ03 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc39a1Q9QZ03 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc39a1Q9QZ03 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc39a1Q9QZ03 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Slc39a1Q9QZ03 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc39a1Q9QZ03 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc39a1Q9QZ03 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc39a1Q9QZ03 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc39a1Q9QZ03 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.7 ms