Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYE3

Bcl11a, B-cell lymphoma/leukemia 11A, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11aQ9QYE3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Bcl11aQ9QYE3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Bcl11aQ9QYE3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Bcl11aQ9QYE3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Bcl11aQ9QYE3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Bcl11aQ9QYE3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Bcl11aQ9QYE3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Bcl11aQ9QYE3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Bcl11aQ9QYE3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Bcl11aQ9QYE3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Bcl11aQ9QYE3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Bcl11aQ9QYE3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Bcl11aQ9QYE3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Bcl11aQ9QYE3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Bcl11aQ9QYE3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Bcl11aQ9QYE3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Bcl11aQ9QYE3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Bcl11aQ9QYE3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Bcl11aQ9QYE3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Bcl11aQ9QYE3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Bcl11aQ9QYE3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Bcl11aQ9QYE3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Bcl11aQ9QYE3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Bcl11aQ9QYE3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Bcl11aQ9QYE3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Bcl11aQ9QYE3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Bcl11aQ9QYE3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Bcl11aQ9QYE3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Bcl11aQ9QYE3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Bcl11aQ9QYE3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Bcl11aQ9QYE3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Bcl11aQ9QYE3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Bcl11aQ9QYE3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Bcl11aQ9QYE3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Bcl11aQ9QYE3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Bcl11aQ9QYE3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Bcl11aQ9QYE3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Bcl11aQ9QYE3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Bcl11aQ9QYE3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Bcl11aQ9QYE3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Bcl11aQ9QYE3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Bcl11aQ9QYE3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Bcl11aQ9QYE3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Bcl11aQ9QYE3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Bcl11aQ9QYE3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Bcl11aQ9QYE3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Bcl11aQ9QYE3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Bcl11aQ9QYE3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Bcl11aQ9QYE3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Bcl11aQ9QYE3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Bcl11aQ9QYE3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Bcl11aQ9QYE3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Bcl11aQ9QYE3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Bcl11aQ9QYE3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Bcl11aQ9QYE3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Bcl11aQ9QYE3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Bcl11aQ9QYE3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Bcl11aQ9QYE3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.2
Bcl11aQ9QYE3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Bcl11aQ9QYE3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Bcl11aQ9QYE3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Bcl11aQ9QYE3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Bcl11aQ9QYE3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Bcl11aQ9QYE3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Bcl11aQ9QYE3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Bcl11aQ9QYE3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Bcl11aQ9QYE3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Bcl11aQ9QYE3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Bcl11aQ9QYE3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Bcl11aQ9QYE3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Bcl11aQ9QYE3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Bcl11aQ9QYE3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Bcl11aQ9QYE3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Bcl11aQ9QYE3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Bcl11aQ9QYE3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Bcl11aQ9QYE3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Bcl11aQ9QYE3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Bcl11aQ9QYE3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Bcl11aQ9QYE3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Bcl11aQ9QYE3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Bcl11aQ9QYE3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Bcl11aQ9QYE3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Bcl11aQ9QYE3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Bcl11aQ9QYE3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Bcl11aQ9QYE3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Bcl11aQ9QYE3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Bcl11aQ9QYE3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Bcl11aQ9QYE3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Bcl11aQ9QYE3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Bcl11aQ9QYE3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Bcl11aQ9QYE3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Bcl11aQ9QYE3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Bcl11aQ9QYE3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Bcl11aQ9QYE3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Bcl11aQ9QYE3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Bcl11aQ9QYE3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Bcl11aQ9QYE3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Bcl11aQ9QYE3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Bcl11aQ9QYE3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Bcl11aQ9QYE3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.9 ms