Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY30

Abcb11, Bile salt export pump, mousemouse

Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb11Q9QY30 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Abcb11Q9QY30 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Abcb11Q9QY30 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Abcb11Q9QY30 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Abcb11Q9QY30 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Abcb11Q9QY30 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Abcb11Q9QY30 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Abcb11Q9QY30 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Abcb11Q9QY30 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Abcb11Q9QY30 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Abcb11Q9QY30 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Abcb11Q9QY30 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Abcb11Q9QY30 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Abcb11Q9QY30 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Abcb11Q9QY30 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Abcb11Q9QY30 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Abcb11Q9QY30 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Abcb11Q9QY30 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Abcb11Q9QY30 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Abcb11Q9QY30 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Abcb11Q9QY30 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Abcb11Q9QY30 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Abcb11Q9QY30 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Abcb11Q9QY30 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Abcb11Q9QY30 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Abcb11Q9QY30 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Abcb11Q9QY30 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Abcb11Q9QY30 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Abcb11Q9QY30 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Abcb11Q9QY30 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Abcb11Q9QY30 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Abcb11Q9QY30 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Abcb11Q9QY30 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Abcb11Q9QY30 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Abcb11Q9QY30 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Abcb11Q9QY30 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Abcb11Q9QY30 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Abcb11Q9QY30 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Abcb11Q9QY30 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Abcb11Q9QY30 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Abcb11Q9QY30 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Abcb11Q9QY30 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Abcb11Q9QY30 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Abcb11Q9QY30 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Abcb11Q9QY30 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Abcb11Q9QY30 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Abcb11Q9QY30 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Abcb11Q9QY30 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Abcb11Q9QY30 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Abcb11Q9QY30 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Abcb11Q9QY30 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Abcb11Q9QY30 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Abcb11Q9QY30 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Abcb11Q9QY30 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Abcb11Q9QY30 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Abcb11Q9QY30 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Abcb11Q9QY30 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Abcb11Q9QY30 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Abcb11Q9QY30 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Abcb11Q9QY30 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Abcb11Q9QY30 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Abcb11Q9QY30 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Abcb11Q9QY30 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Abcb11Q9QY30 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Abcb11Q9QY30 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Abcb11Q9QY30 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Abcb11Q9QY30 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Abcb11Q9QY30 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Abcb11Q9QY30 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Abcb11Q9QY30 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Abcb11Q9QY30 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Abcb11Q9QY30 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Abcb11Q9QY30 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Abcb11Q9QY30 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Abcb11Q9QY30 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Abcb11Q9QY30 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Abcb11Q9QY30 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Abcb11Q9QY30 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Abcb11Q9QY30 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Abcb11Q9QY30 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Abcb11Q9QY30 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Abcb11Q9QY30 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Abcb11Q9QY30 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Abcb11Q9QY30 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Abcb11Q9QY30 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Abcb11Q9QY30 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Abcb11Q9QY30 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Abcb11Q9QY30 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Abcb11Q9QY30 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Abcb11Q9QY30 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Abcb11Q9QY30 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Abcb11Q9QY30 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Abcb11Q9QY30 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Abcb11Q9QY30 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Abcb11Q9QY30 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Abcb11Q9QY30 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Abcb11Q9QY30 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Abcb11Q9QY30 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Abcb11Q9QY30 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Abcb11Q9QY30 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms