Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXF8

Gnmt, Glycine N-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GnmtQ9QXF8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GnmtQ9QXF8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GnmtQ9QXF8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GnmtQ9QXF8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GnmtQ9QXF8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GnmtQ9QXF8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GnmtQ9QXF8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GnmtQ9QXF8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GnmtQ9QXF8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GnmtQ9QXF8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GnmtQ9QXF8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GnmtQ9QXF8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GnmtQ9QXF8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GnmtQ9QXF8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GnmtQ9QXF8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GnmtQ9QXF8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GnmtQ9QXF8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GnmtQ9QXF8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GnmtQ9QXF8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GnmtQ9QXF8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GnmtQ9QXF8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GnmtQ9QXF8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GnmtQ9QXF8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GnmtQ9QXF8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GnmtQ9QXF8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
GnmtQ9QXF8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GnmtQ9QXF8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GnmtQ9QXF8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GnmtQ9QXF8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GnmtQ9QXF8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GnmtQ9QXF8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GnmtQ9QXF8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
GnmtQ9QXF8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GnmtQ9QXF8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GnmtQ9QXF8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GnmtQ9QXF8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GnmtQ9QXF8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GnmtQ9QXF8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GnmtQ9QXF8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
GnmtQ9QXF8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
GnmtQ9QXF8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GnmtQ9QXF8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GnmtQ9QXF8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GnmtQ9QXF8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GnmtQ9QXF8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GnmtQ9QXF8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GnmtQ9QXF8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GnmtQ9QXF8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GnmtQ9QXF8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GnmtQ9QXF8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
GnmtQ9QXF8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
GnmtQ9QXF8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
GnmtQ9QXF8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
GnmtQ9QXF8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GnmtQ9QXF8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GnmtQ9QXF8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GnmtQ9QXF8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GnmtQ9QXF8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GnmtQ9QXF8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GnmtQ9QXF8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GnmtQ9QXF8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GnmtQ9QXF8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GnmtQ9QXF8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GnmtQ9QXF8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GnmtQ9QXF8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GnmtQ9QXF8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GnmtQ9QXF8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GnmtQ9QXF8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GnmtQ9QXF8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GnmtQ9QXF8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GnmtQ9QXF8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GnmtQ9QXF8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GnmtQ9QXF8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GnmtQ9QXF8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GnmtQ9QXF8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GnmtQ9QXF8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GnmtQ9QXF8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GnmtQ9QXF8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GnmtQ9QXF8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GnmtQ9QXF8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GnmtQ9QXF8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GnmtQ9QXF8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GnmtQ9QXF8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GnmtQ9QXF8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GnmtQ9QXF8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GnmtQ9QXF8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GnmtQ9QXF8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GnmtQ9QXF8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GnmtQ9QXF8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GnmtQ9QXF8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GnmtQ9QXF8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GnmtQ9QXF8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GnmtQ9QXF8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GnmtQ9QXF8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GnmtQ9QXF8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GnmtQ9QXF8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GnmtQ9QXF8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GnmtQ9QXF8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GnmtQ9QXF8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
GnmtQ9QXF8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms