Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA1

Cyhr1, Cysteine and histidine-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyhr1Q9QXA1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyhr1Q9QXA1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyhr1Q9QXA1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyhr1Q9QXA1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cyhr1Q9QXA1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cyhr1Q9QXA1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cyhr1Q9QXA1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cyhr1Q9QXA1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cyhr1Q9QXA1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cyhr1Q9QXA1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyhr1Q9QXA1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyhr1Q9QXA1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyhr1Q9QXA1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyhr1Q9QXA1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyhr1Q9QXA1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyhr1Q9QXA1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyhr1Q9QXA1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cyhr1Q9QXA1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cyhr1Q9QXA1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cyhr1Q9QXA1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Cyhr1Q9QXA1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyhr1Q9QXA1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyhr1Q9QXA1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyhr1Q9QXA1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyhr1Q9QXA1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyhr1Q9QXA1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyhr1Q9QXA1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyhr1Q9QXA1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyhr1Q9QXA1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyhr1Q9QXA1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cyhr1Q9QXA1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Cyhr1Q9QXA1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cyhr1Q9QXA1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cyhr1Q9QXA1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cyhr1Q9QXA1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cyhr1Q9QXA1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cyhr1Q9QXA1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cyhr1Q9QXA1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cyhr1Q9QXA1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cyhr1Q9QXA1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cyhr1Q9QXA1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cyhr1Q9QXA1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cyhr1Q9QXA1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cyhr1Q9QXA1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cyhr1Q9QXA1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cyhr1Q9QXA1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cyhr1Q9QXA1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cyhr1Q9QXA1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Cyhr1Q9QXA1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cyhr1Q9QXA1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cyhr1Q9QXA1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cyhr1Q9QXA1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cyhr1Q9QXA1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cyhr1Q9QXA1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Cyhr1Q9QXA1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cyhr1Q9QXA1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cyhr1Q9QXA1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cyhr1Q9QXA1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cyhr1Q9QXA1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cyhr1Q9QXA1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cyhr1Q9QXA1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cyhr1Q9QXA1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cyhr1Q9QXA1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cyhr1Q9QXA1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cyhr1Q9QXA1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cyhr1Q9QXA1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cyhr1Q9QXA1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cyhr1Q9QXA1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cyhr1Q9QXA1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cyhr1Q9QXA1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cyhr1Q9QXA1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cyhr1Q9QXA1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cyhr1Q9QXA1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cyhr1Q9QXA1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cyhr1Q9QXA1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cyhr1Q9QXA1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cyhr1Q9QXA1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cyhr1Q9QXA1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cyhr1Q9QXA1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Cyhr1Q9QXA1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cyhr1Q9QXA1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cyhr1Q9QXA1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cyhr1Q9QXA1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cyhr1Q9QXA1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cyhr1Q9QXA1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cyhr1Q9QXA1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cyhr1Q9QXA1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cyhr1Q9QXA1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cyhr1Q9QXA1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cyhr1Q9QXA1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cyhr1Q9QXA1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cyhr1Q9QXA1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Cyhr1Q9QXA1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cyhr1Q9QXA1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cyhr1Q9QXA1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Cyhr1Q9QXA1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Cyhr1Q9QXA1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cyhr1Q9QXA1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cyhr1Q9QXA1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cyhr1Q9QXA1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms