Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK0

Cdkl2, Cyclin-dependent kinase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl2Q9QUK0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdkl2Q9QUK0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdkl2Q9QUK0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdkl2Q9QUK0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdkl2Q9QUK0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdkl2Q9QUK0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdkl2Q9QUK0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdkl2Q9QUK0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdkl2Q9QUK0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdkl2Q9QUK0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdkl2Q9QUK0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdkl2Q9QUK0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdkl2Q9QUK0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdkl2Q9QUK0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdkl2Q9QUK0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdkl2Q9QUK0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdkl2Q9QUK0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdkl2Q9QUK0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdkl2Q9QUK0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdkl2Q9QUK0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdkl2Q9QUK0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdkl2Q9QUK0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdkl2Q9QUK0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cdkl2Q9QUK0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdkl2Q9QUK0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdkl2Q9QUK0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdkl2Q9QUK0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdkl2Q9QUK0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdkl2Q9QUK0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdkl2Q9QUK0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdkl2Q9QUK0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdkl2Q9QUK0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdkl2Q9QUK0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdkl2Q9QUK0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdkl2Q9QUK0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdkl2Q9QUK0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdkl2Q9QUK0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdkl2Q9QUK0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdkl2Q9QUK0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdkl2Q9QUK0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdkl2Q9QUK0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdkl2Q9QUK0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdkl2Q9QUK0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdkl2Q9QUK0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdkl2Q9QUK0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdkl2Q9QUK0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdkl2Q9QUK0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdkl2Q9QUK0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdkl2Q9QUK0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdkl2Q9QUK0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdkl2Q9QUK0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdkl2Q9QUK0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdkl2Q9QUK0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdkl2Q9QUK0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdkl2Q9QUK0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdkl2Q9QUK0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdkl2Q9QUK0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdkl2Q9QUK0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdkl2Q9QUK0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdkl2Q9QUK0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdkl2Q9QUK0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdkl2Q9QUK0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdkl2Q9QUK0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdkl2Q9QUK0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdkl2Q9QUK0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdkl2Q9QUK0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdkl2Q9QUK0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdkl2Q9QUK0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdkl2Q9QUK0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdkl2Q9QUK0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdkl2Q9QUK0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdkl2Q9QUK0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdkl2Q9QUK0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdkl2Q9QUK0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdkl2Q9QUK0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdkl2Q9QUK0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdkl2Q9QUK0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdkl2Q9QUK0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdkl2Q9QUK0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdkl2Q9QUK0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdkl2Q9QUK0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdkl2Q9QUK0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdkl2Q9QUK0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdkl2Q9QUK0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdkl2Q9QUK0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdkl2Q9QUK0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdkl2Q9QUK0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdkl2Q9QUK0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdkl2Q9QUK0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdkl2Q9QUK0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdkl2Q9QUK0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdkl2Q9QUK0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdkl2Q9QUK0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdkl2Q9QUK0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdkl2Q9QUK0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdkl2Q9QUK0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdkl2Q9QUK0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdkl2Q9QUK0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdkl2Q9QUK0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdkl2Q9QUK0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.3 ms