Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL89

Ninj2, Ninjurin-2, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ninj2Q9JL89 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ninj2Q9JL89 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ninj2Q9JL89 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ninj2Q9JL89 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ninj2Q9JL89 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ninj2Q9JL89 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ninj2Q9JL89 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ninj2Q9JL89 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ninj2Q9JL89 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ninj2Q9JL89 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ninj2Q9JL89 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ninj2Q9JL89 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ninj2Q9JL89 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ninj2Q9JL89 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ninj2Q9JL89 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ninj2Q9JL89 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ninj2Q9JL89 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ninj2Q9JL89 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ninj2Q9JL89 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ninj2Q9JL89 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ninj2Q9JL89 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ninj2Q9JL89 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ninj2Q9JL89 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ninj2Q9JL89 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ninj2Q9JL89 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ninj2Q9JL89 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ninj2Q9JL89 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ninj2Q9JL89 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ninj2Q9JL89 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ninj2Q9JL89 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ninj2Q9JL89 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ninj2Q9JL89 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ninj2Q9JL89 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ninj2Q9JL89 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ninj2Q9JL89 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ninj2Q9JL89 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ninj2Q9JL89 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ninj2Q9JL89 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ninj2Q9JL89 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ninj2Q9JL89 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ninj2Q9JL89 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ninj2Q9JL89 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ninj2Q9JL89 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ninj2Q9JL89 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ninj2Q9JL89 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ninj2Q9JL89 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ninj2Q9JL89 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ninj2Q9JL89 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ninj2Q9JL89 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ninj2Q9JL89 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ninj2Q9JL89 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ninj2Q9JL89 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ninj2Q9JL89 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ninj2Q9JL89 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ninj2Q9JL89 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ninj2Q9JL89 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ninj2Q9JL89 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ninj2Q9JL89 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ninj2Q9JL89 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ninj2Q9JL89 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ninj2Q9JL89 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ninj2Q9JL89 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ninj2Q9JL89 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ninj2Q9JL89 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ninj2Q9JL89 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ninj2Q9JL89 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ninj2Q9JL89 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ninj2Q9JL89 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ninj2Q9JL89 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ninj2Q9JL89 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ninj2Q9JL89 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ninj2Q9JL89 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ninj2Q9JL89 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ninj2Q9JL89 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ninj2Q9JL89 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ninj2Q9JL89 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ninj2Q9JL89 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ninj2Q9JL89 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ninj2Q9JL89 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ninj2Q9JL89 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ninj2Q9JL89 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ninj2Q9JL89 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ninj2Q9JL89 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ninj2Q9JL89 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ninj2Q9JL89 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ninj2Q9JL89 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ninj2Q9JL89 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ninj2Q9JL89 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ninj2Q9JL89 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ninj2Q9JL89 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ninj2Q9JL89 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ninj2Q9JL89 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ninj2Q9JL89 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ninj2Q9JL89 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ninj2Q9JL89 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ninj2Q9JL89 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ninj2Q9JL89 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ninj2Q9JL89 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ninj2Q9JL89 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ninj2Q9JL89 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms