Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL18

Bace2, Beta-secretase 2, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace2Q9JL18 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Bace2Q9JL18 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Bace2Q9JL18 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Bace2Q9JL18 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Bace2Q9JL18 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Bace2Q9JL18 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Bace2Q9JL18 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Bace2Q9JL18 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Bace2Q9JL18 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Bace2Q9JL18 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Bace2Q9JL18 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Bace2Q9JL18 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Bace2Q9JL18 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Bace2Q9JL18 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Bace2Q9JL18 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Bace2Q9JL18 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Bace2Q9JL18 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Bace2Q9JL18 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Bace2Q9JL18 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Bace2Q9JL18 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Bace2Q9JL18 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Bace2Q9JL18 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Bace2Q9JL18 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Bace2Q9JL18 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Bace2Q9JL18 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Bace2Q9JL18 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Bace2Q9JL18 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Bace2Q9JL18 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bace2Q9JL18 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bace2Q9JL18 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Bace2Q9JL18 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bace2Q9JL18 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Bace2Q9JL18 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Bace2Q9JL18 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Bace2Q9JL18 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Bace2Q9JL18 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Bace2Q9JL18 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Bace2Q9JL18 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Bace2Q9JL18 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Bace2Q9JL18 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Bace2Q9JL18 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Bace2Q9JL18 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Bace2Q9JL18 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Bace2Q9JL18 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Bace2Q9JL18 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Bace2Q9JL18 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Bace2Q9JL18 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Bace2Q9JL18 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Bace2Q9JL18 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Bace2Q9JL18 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Bace2Q9JL18 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Bace2Q9JL18 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Bace2Q9JL18 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Bace2Q9JL18 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Bace2Q9JL18 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Bace2Q9JL18 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Bace2Q9JL18 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Bace2Q9JL18 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Bace2Q9JL18 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Bace2Q9JL18 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Bace2Q9JL18 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Bace2Q9JL18 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Bace2Q9JL18 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Bace2Q9JL18 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Bace2Q9JL18 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Bace2Q9JL18 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Bace2Q9JL18 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Bace2Q9JL18 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Bace2Q9JL18 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Bace2Q9JL18 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Bace2Q9JL18 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Bace2Q9JL18 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Bace2Q9JL18 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Bace2Q9JL18 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Bace2Q9JL18 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Bace2Q9JL18 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Bace2Q9JL18 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Bace2Q9JL18 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Bace2Q9JL18 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Bace2Q9JL18 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Bace2Q9JL18 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Bace2Q9JL18 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Bace2Q9JL18 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Bace2Q9JL18 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Bace2Q9JL18 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Bace2Q9JL18 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Bace2Q9JL18 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Bace2Q9JL18 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Bace2Q9JL18 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Bace2Q9JL18 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Bace2Q9JL18 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Bace2Q9JL18 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Bace2Q9JL18 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Bace2Q9JL18 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Bace2Q9JL18 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Bace2Q9JL18 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Bace2Q9JL18 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Bace2Q9JL18 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Bace2Q9JL18 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
Bace2Q9JL18 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 246.3 ms