Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC7

Ap4m1, AP-4 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4m1Q9JKC7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ap4m1Q9JKC7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ap4m1Q9JKC7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ap4m1Q9JKC7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ap4m1Q9JKC7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ap4m1Q9JKC7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ap4m1Q9JKC7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ap4m1Q9JKC7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ap4m1Q9JKC7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ap4m1Q9JKC7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ap4m1Q9JKC7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ap4m1Q9JKC7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ap4m1Q9JKC7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ap4m1Q9JKC7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ap4m1Q9JKC7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ap4m1Q9JKC7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ap4m1Q9JKC7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ap4m1Q9JKC7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ap4m1Q9JKC7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ap4m1Q9JKC7 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ap4m1Q9JKC7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ap4m1Q9JKC7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ap4m1Q9JKC7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ap4m1Q9JKC7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ap4m1Q9JKC7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ap4m1Q9JKC7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ap4m1Q9JKC7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ap4m1Q9JKC7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ap4m1Q9JKC7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ap4m1Q9JKC7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ap4m1Q9JKC7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ap4m1Q9JKC7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ap4m1Q9JKC7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ap4m1Q9JKC7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ap4m1Q9JKC7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ap4m1Q9JKC7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ap4m1Q9JKC7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ap4m1Q9JKC7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ap4m1Q9JKC7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Ap4m1Q9JKC7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ap4m1Q9JKC7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ap4m1Q9JKC7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ap4m1Q9JKC7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ap4m1Q9JKC7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ap4m1Q9JKC7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ap4m1Q9JKC7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ap4m1Q9JKC7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ap4m1Q9JKC7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ap4m1Q9JKC7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ap4m1Q9JKC7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ap4m1Q9JKC7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ap4m1Q9JKC7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ap4m1Q9JKC7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ap4m1Q9JKC7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ap4m1Q9JKC7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ap4m1Q9JKC7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ap4m1Q9JKC7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ap4m1Q9JKC7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ap4m1Q9JKC7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ap4m1Q9JKC7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ap4m1Q9JKC7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ap4m1Q9JKC7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ap4m1Q9JKC7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ap4m1Q9JKC7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ap4m1Q9JKC7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ap4m1Q9JKC7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ap4m1Q9JKC7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ap4m1Q9JKC7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ap4m1Q9JKC7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ap4m1Q9JKC7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ap4m1Q9JKC7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ap4m1Q9JKC7 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ap4m1Q9JKC7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ap4m1Q9JKC7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ap4m1Q9JKC7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ap4m1Q9JKC7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ap4m1Q9JKC7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ap4m1Q9JKC7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ap4m1Q9JKC7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ap4m1Q9JKC7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ap4m1Q9JKC7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ap4m1Q9JKC7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ap4m1Q9JKC7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ap4m1Q9JKC7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ap4m1Q9JKC7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ap4m1Q9JKC7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ap4m1Q9JKC7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ap4m1Q9JKC7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ap4m1Q9JKC7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ap4m1Q9JKC7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ap4m1Q9JKC7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ap4m1Q9JKC7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ap4m1Q9JKC7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ap4m1Q9JKC7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ap4m1Q9JKC7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ap4m1Q9JKC7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ap4m1Q9JKC7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ap4m1Q9JKC7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ap4m1Q9JKC7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ap4m1Q9JKC7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms