Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIF7

Copb1, Coatomer subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb1Q9JIF7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Copb1Q9JIF7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Copb1Q9JIF7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Copb1Q9JIF7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Copb1Q9JIF7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Copb1Q9JIF7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Copb1Q9JIF7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Copb1Q9JIF7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Copb1Q9JIF7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Copb1Q9JIF7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Copb1Q9JIF7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Copb1Q9JIF7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Copb1Q9JIF7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Copb1Q9JIF7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Copb1Q9JIF7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Copb1Q9JIF7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Copb1Q9JIF7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Copb1Q9JIF7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Copb1Q9JIF7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Copb1Q9JIF7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Copb1Q9JIF7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Copb1Q9JIF7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Copb1Q9JIF7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Copb1Q9JIF7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Copb1Q9JIF7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Copb1Q9JIF7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Copb1Q9JIF7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Copb1Q9JIF7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Copb1Q9JIF7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Copb1Q9JIF7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Copb1Q9JIF7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Copb1Q9JIF7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Copb1Q9JIF7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Copb1Q9JIF7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Copb1Q9JIF7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Copb1Q9JIF7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Copb1Q9JIF7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Copb1Q9JIF7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Copb1Q9JIF7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Copb1Q9JIF7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Copb1Q9JIF7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Copb1Q9JIF7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Copb1Q9JIF7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Copb1Q9JIF7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Copb1Q9JIF7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Copb1Q9JIF7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Copb1Q9JIF7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Copb1Q9JIF7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Copb1Q9JIF7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Copb1Q9JIF7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Copb1Q9JIF7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Copb1Q9JIF7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Copb1Q9JIF7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Copb1Q9JIF7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Copb1Q9JIF7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Copb1Q9JIF7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Copb1Q9JIF7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Copb1Q9JIF7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Copb1Q9JIF7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Copb1Q9JIF7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Copb1Q9JIF7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Copb1Q9JIF7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Copb1Q9JIF7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Copb1Q9JIF7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Copb1Q9JIF7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Copb1Q9JIF7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Copb1Q9JIF7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Copb1Q9JIF7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Copb1Q9JIF7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Copb1Q9JIF7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Copb1Q9JIF7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Copb1Q9JIF7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Copb1Q9JIF7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Copb1Q9JIF7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Copb1Q9JIF7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Copb1Q9JIF7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Copb1Q9JIF7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Copb1Q9JIF7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Copb1Q9JIF7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Copb1Q9JIF7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Copb1Q9JIF7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Copb1Q9JIF7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Copb1Q9JIF7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Copb1Q9JIF7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Copb1Q9JIF7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Copb1Q9JIF7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Copb1Q9JIF7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Copb1Q9JIF7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Copb1Q9JIF7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Copb1Q9JIF7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Copb1Q9JIF7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Copb1Q9JIF7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Copb1Q9JIF7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Copb1Q9JIF7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Copb1Q9JIF7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Copb1Q9JIF7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Copb1Q9JIF7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Copb1Q9JIF7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Copb1Q9JIF7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Copb1Q9JIF7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms