Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tcirg1Q9JHF5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tcirg1Q9JHF5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tcirg1Q9JHF5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tcirg1Q9JHF5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tcirg1Q9JHF5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tcirg1Q9JHF5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Tcirg1Q9JHF5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tcirg1Q9JHF5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tcirg1Q9JHF5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tcirg1Q9JHF5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tcirg1Q9JHF5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Tcirg1Q9JHF5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tcirg1Q9JHF5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tcirg1Q9JHF5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tcirg1Q9JHF5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tcirg1Q9JHF5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tcirg1Q9JHF5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tcirg1Q9JHF5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tcirg1Q9JHF5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tcirg1Q9JHF5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tcirg1Q9JHF5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tcirg1Q9JHF5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tcirg1Q9JHF5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tcirg1Q9JHF5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tcirg1Q9JHF5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tcirg1Q9JHF5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tcirg1Q9JHF5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tcirg1Q9JHF5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tcirg1Q9JHF5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tcirg1Q9JHF5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Tcirg1Q9JHF5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tcirg1Q9JHF5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tcirg1Q9JHF5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tcirg1Q9JHF5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Tcirg1Q9JHF5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tcirg1Q9JHF5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tcirg1Q9JHF5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tcirg1Q9JHF5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tcirg1Q9JHF5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tcirg1Q9JHF5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tcirg1Q9JHF5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tcirg1Q9JHF5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tcirg1Q9JHF5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tcirg1Q9JHF5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Tcirg1Q9JHF5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tcirg1Q9JHF5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tcirg1Q9JHF5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tcirg1Q9JHF5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tcirg1Q9JHF5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tcirg1Q9JHF5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tcirg1Q9JHF5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tcirg1Q9JHF5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Tcirg1Q9JHF5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tcirg1Q9JHF5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tcirg1Q9JHF5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Tcirg1Q9JHF5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tcirg1Q9JHF5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tcirg1Q9JHF5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tcirg1Q9JHF5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tcirg1Q9JHF5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tcirg1Q9JHF5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tcirg1Q9JHF5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tcirg1Q9JHF5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tcirg1Q9JHF5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tcirg1Q9JHF5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Tcirg1Q9JHF5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Tcirg1Q9JHF5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tcirg1Q9JHF5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tcirg1Q9JHF5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tcirg1Q9JHF5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tcirg1Q9JHF5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tcirg1Q9JHF5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tcirg1Q9JHF5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tcirg1Q9JHF5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tcirg1Q9JHF5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tcirg1Q9JHF5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tcirg1Q9JHF5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tcirg1Q9JHF5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tcirg1Q9JHF5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tcirg1Q9JHF5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tcirg1Q9JHF5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tcirg1Q9JHF5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tcirg1Q9JHF5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tcirg1Q9JHF5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tcirg1Q9JHF5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tcirg1Q9JHF5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tcirg1Q9JHF5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tcirg1Q9JHF5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tcirg1Q9JHF5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tcirg1Q9JHF5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Tcirg1Q9JHF5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tcirg1Q9JHF5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tcirg1Q9JHF5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tcirg1Q9JHF5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tcirg1Q9JHF5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tcirg1Q9JHF5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tcirg1Q9JHF5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tcirg1Q9JHF5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tcirg1Q9JHF5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms