Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQW4

Cyp3a44, Cytochrome P450, CYP3A, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp3a44Q9EQW4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cyp3a44Q9EQW4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cyp3a44Q9EQW4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cyp3a44Q9EQW4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cyp3a44Q9EQW4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cyp3a44Q9EQW4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cyp3a44Q9EQW4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cyp3a44Q9EQW4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cyp3a44Q9EQW4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyp3a44Q9EQW4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyp3a44Q9EQW4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cyp3a44Q9EQW4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Cyp3a44Q9EQW4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cyp3a44Q9EQW4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cyp3a44Q9EQW4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cyp3a44Q9EQW4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cyp3a44Q9EQW4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cyp3a44Q9EQW4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cyp3a44Q9EQW4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cyp3a44Q9EQW4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cyp3a44Q9EQW4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Cyp3a44Q9EQW4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyp3a44Q9EQW4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyp3a44Q9EQW4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyp3a44Q9EQW4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyp3a44Q9EQW4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyp3a44Q9EQW4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyp3a44Q9EQW4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyp3a44Q9EQW4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyp3a44Q9EQW4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyp3a44Q9EQW4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cyp3a44Q9EQW4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cyp3a44Q9EQW4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cyp3a44Q9EQW4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cyp3a44Q9EQW4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cyp3a44Q9EQW4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cyp3a44Q9EQW4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cyp3a44Q9EQW4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cyp3a44Q9EQW4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cyp3a44Q9EQW4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cyp3a44Q9EQW4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cyp3a44Q9EQW4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cyp3a44Q9EQW4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyp3a44Q9EQW4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyp3a44Q9EQW4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyp3a44Q9EQW4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyp3a44Q9EQW4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyp3a44Q9EQW4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cyp3a44Q9EQW4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cyp3a44Q9EQW4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyp3a44Q9EQW4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyp3a44Q9EQW4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cyp3a44Q9EQW4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cyp3a44Q9EQW4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cyp3a44Q9EQW4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cyp3a44Q9EQW4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cyp3a44Q9EQW4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cyp3a44Q9EQW4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyp3a44Q9EQW4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyp3a44Q9EQW4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyp3a44Q9EQW4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyp3a44Q9EQW4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyp3a44Q9EQW4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyp3a44Q9EQW4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyp3a44Q9EQW4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyp3a44Q9EQW4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyp3a44Q9EQW4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyp3a44Q9EQW4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyp3a44Q9EQW4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyp3a44Q9EQW4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyp3a44Q9EQW4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cyp3a44Q9EQW4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cyp3a44Q9EQW4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cyp3a44Q9EQW4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cyp3a44Q9EQW4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cyp3a44Q9EQW4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cyp3a44Q9EQW4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cyp3a44Q9EQW4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cyp3a44Q9EQW4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cyp3a44Q9EQW4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cyp3a44Q9EQW4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cyp3a44Q9EQW4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cyp3a44Q9EQW4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cyp3a44Q9EQW4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cyp3a44Q9EQW4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cyp3a44Q9EQW4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cyp3a44Q9EQW4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cyp3a44Q9EQW4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cyp3a44Q9EQW4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cyp3a44Q9EQW4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cyp3a44Q9EQW4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cyp3a44Q9EQW4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cyp3a44Q9EQW4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cyp3a44Q9EQW4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cyp3a44Q9EQW4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cyp3a44Q9EQW4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cyp3a44Q9EQW4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cyp3a44Q9EQW4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cyp3a44Q9EQW4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cyp3a44Q9EQW4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.4 ms