Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQS3

Mycbp, c-Myc-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MycbpQ9EQS3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MycbpQ9EQS3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MycbpQ9EQS3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MycbpQ9EQS3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MycbpQ9EQS3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MycbpQ9EQS3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MycbpQ9EQS3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MycbpQ9EQS3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MycbpQ9EQS3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MycbpQ9EQS3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MycbpQ9EQS3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MycbpQ9EQS3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MycbpQ9EQS3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MycbpQ9EQS3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MycbpQ9EQS3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MycbpQ9EQS3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MycbpQ9EQS3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MycbpQ9EQS3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MycbpQ9EQS3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MycbpQ9EQS3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MycbpQ9EQS3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MycbpQ9EQS3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MycbpQ9EQS3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MycbpQ9EQS3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MycbpQ9EQS3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MycbpQ9EQS3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MycbpQ9EQS3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MycbpQ9EQS3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MycbpQ9EQS3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MycbpQ9EQS3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MycbpQ9EQS3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MycbpQ9EQS3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MycbpQ9EQS3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MycbpQ9EQS3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MycbpQ9EQS3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MycbpQ9EQS3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MycbpQ9EQS3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MycbpQ9EQS3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MycbpQ9EQS3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MycbpQ9EQS3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MycbpQ9EQS3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MycbpQ9EQS3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MycbpQ9EQS3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MycbpQ9EQS3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MycbpQ9EQS3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MycbpQ9EQS3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MycbpQ9EQS3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MycbpQ9EQS3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MycbpQ9EQS3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MycbpQ9EQS3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MycbpQ9EQS3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MycbpQ9EQS3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MycbpQ9EQS3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MycbpQ9EQS3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MycbpQ9EQS3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
MycbpQ9EQS3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MycbpQ9EQS3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MycbpQ9EQS3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MycbpQ9EQS3 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MycbpQ9EQS3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MycbpQ9EQS3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MycbpQ9EQS3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MycbpQ9EQS3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MycbpQ9EQS3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MycbpQ9EQS3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MycbpQ9EQS3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MycbpQ9EQS3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MycbpQ9EQS3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MycbpQ9EQS3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MycbpQ9EQS3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MycbpQ9EQS3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MycbpQ9EQS3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MycbpQ9EQS3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MycbpQ9EQS3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MycbpQ9EQS3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MycbpQ9EQS3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
MycbpQ9EQS3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MycbpQ9EQS3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MycbpQ9EQS3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MycbpQ9EQS3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MycbpQ9EQS3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MycbpQ9EQS3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MycbpQ9EQS3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MycbpQ9EQS3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MycbpQ9EQS3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MycbpQ9EQS3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MycbpQ9EQS3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MycbpQ9EQS3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MycbpQ9EQS3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MycbpQ9EQS3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MycbpQ9EQS3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MycbpQ9EQS3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MycbpQ9EQS3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MycbpQ9EQS3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MycbpQ9EQS3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MycbpQ9EQS3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MycbpQ9EQS3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MycbpQ9EQS3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MycbpQ9EQS3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MycbpQ9EQS3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms