Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPU5

Tnfrsf21, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 21, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf21Q9EPU5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnfrsf21Q9EPU5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnfrsf21Q9EPU5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tnfrsf21Q9EPU5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnfrsf21Q9EPU5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnfrsf21Q9EPU5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnfrsf21Q9EPU5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnfrsf21Q9EPU5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnfrsf21Q9EPU5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnfrsf21Q9EPU5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms