Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL5

Mmp1a, Interstitial collagenase A, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp1aQ9EPL5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mmp1aQ9EPL5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Mmp1aQ9EPL5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Mmp1aQ9EPL5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mmp1aQ9EPL5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Mmp1aQ9EPL5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mmp1aQ9EPL5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mmp1aQ9EPL5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mmp1aQ9EPL5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mmp1aQ9EPL5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mmp1aQ9EPL5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mmp1aQ9EPL5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mmp1aQ9EPL5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mmp1aQ9EPL5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mmp1aQ9EPL5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mmp1aQ9EPL5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mmp1aQ9EPL5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Mmp1aQ9EPL5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mmp1aQ9EPL5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mmp1aQ9EPL5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mmp1aQ9EPL5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mmp1aQ9EPL5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mmp1aQ9EPL5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mmp1aQ9EPL5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mmp1aQ9EPL5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mmp1aQ9EPL5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mmp1aQ9EPL5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mmp1aQ9EPL5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mmp1aQ9EPL5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mmp1aQ9EPL5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mmp1aQ9EPL5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mmp1aQ9EPL5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mmp1aQ9EPL5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mmp1aQ9EPL5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Mmp1aQ9EPL5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mmp1aQ9EPL5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mmp1aQ9EPL5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mmp1aQ9EPL5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mmp1aQ9EPL5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mmp1aQ9EPL5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Mmp1aQ9EPL5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Mmp1aQ9EPL5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mmp1aQ9EPL5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mmp1aQ9EPL5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mmp1aQ9EPL5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mmp1aQ9EPL5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Mmp1aQ9EPL5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mmp1aQ9EPL5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mmp1aQ9EPL5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mmp1aQ9EPL5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mmp1aQ9EPL5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Mmp1aQ9EPL5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Mmp1aQ9EPL5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mmp1aQ9EPL5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mmp1aQ9EPL5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mmp1aQ9EPL5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Mmp1aQ9EPL5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mmp1aQ9EPL5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mmp1aQ9EPL5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mmp1aQ9EPL5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mmp1aQ9EPL5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Mmp1aQ9EPL5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mmp1aQ9EPL5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Mmp1aQ9EPL5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mmp1aQ9EPL5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mmp1aQ9EPL5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mmp1aQ9EPL5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mmp1aQ9EPL5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mmp1aQ9EPL5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mmp1aQ9EPL5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mmp1aQ9EPL5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mmp1aQ9EPL5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Mmp1aQ9EPL5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Mmp1aQ9EPL5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Mmp1aQ9EPL5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mmp1aQ9EPL5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mmp1aQ9EPL5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mmp1aQ9EPL5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mmp1aQ9EPL5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mmp1aQ9EPL5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mmp1aQ9EPL5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mmp1aQ9EPL5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mmp1aQ9EPL5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mmp1aQ9EPL5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mmp1aQ9EPL5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mmp1aQ9EPL5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mmp1aQ9EPL5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mmp1aQ9EPL5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mmp1aQ9EPL5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mmp1aQ9EPL5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Mmp1aQ9EPL5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mmp1aQ9EPL5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mmp1aQ9EPL5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Mmp1aQ9EPL5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mmp1aQ9EPL5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mmp1aQ9EPL5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mmp1aQ9EPL5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mmp1aQ9EPL5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Mmp1aQ9EPL5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mmp1aQ9EPL5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms